slurm同时运行不同文件夹下的任务
时间: 2024-11-03 08:19:47 浏览: 23
slurm-docker:在docker上运行Slurm的容器
在Slurm(Sun Grid Engine)环境下,如果你想同时运行位于不同文件夹下的任务,你需要在作业脚本中明确指定任务的位置。以下是一般的步骤:
1. **准备作业脚本**:对于每一个任务,你都需要有一个独立的脚本,例如task1.sh在tasks1目录下,task2.sh在tasks2目录下。每个脚本应含有具体的命令行任务,比如:
```bash
#!/bin/bash
cd /path/to/tasks1
command_to_run_in_task1
```
2. **数组变量遍历**:如果你有多个不同的任务文件夹,并希望按顺序执行,可以在作业脚本中使用`slurm_array`,如`SLURM_ARRAY=1,2,3`,然后循环遍历:
```bash
for task_file in $(ls -1 $SLURM_ARRAY); do
sbatch --array=$task_file tasks/$task_file.sh
done
```
这样,`$task_file.sh`会被替换为`tasks1.sh`, `tasks2.sh`, 等等。
3. **作业调度**:使用`sbatch`命令逐个提交这些任务脚本,比如上面的循环内,每个迭代都会执行一个新的任务。
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