fit <- ols(log(TBIL) ~ rcs(ln_PBDE28,4)+sex+age+race+PIR_group+BMI_group+cotinine+time+time2,data=dt1,weights = WTMEC)
时间: 2023-09-25 14:12:10 浏览: 70
根据你提供的代码,我看到你使用了`ols`函数来进行线性回归分析。在这个模型中,你的因变量是`log(TBIL)`,自变量包括`ln_PBDE28`(采用了4个自由度的样条函数形式),以及其他一些控制变量,如`sex`、`age`、`race`、`PIR_group`、`BMI_group`、`cotinine`、`time`和`time2`。此外,你还使用了权重变量`WTMEC`来考虑样本的加权情况。
需要注意的是,我只是解释了你给出的代码,并没有运行它。如果你需要进一步的帮助,或者有其他问题,请随时提问。
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ndvi<-rast("D:/tt/ndvi00_21.tif") #多波段 tmp<-rast("D:/tt/Newtmp00_21.tif") #多波段 pre<-rast("D:/tt/Newpre00_21.tif") #多波段 ndvi_tmp_pre <- c(ndvi,tmp,pre) #栅格数据集 fun_linear <- function(x){ #删除数据不连续含有NA的像元 ndvi_l<-x[1:22] tmp_l<-x[23:44] pre_l<-x[45:66] if(length(na.omit(ndvi_l))<22 || length(na.omit(tmp_l))<22 || length(na.omit(pre_l))<22) return(c(NA, NA, NA, NA)) lm_ols<-lm(ndvi_1~tmp_l+pre_l) #OLS lm_std<-lm(scale(ndvi_l)~scale(tmp_l)+scale(pre_l)) #对回归模型进行标准化 smr<- summary(lm_std) tmp_stdcor <- smr$coefficients[,"Estimate"][2] pre_stdcor <- smr$coefficients[,"Estimate"][3] tmp_pvalue <- smr$coefficients[,"Pr(>|t|)"][2] pre_pvalue <- smr$coefficients[,"Pr(>|t|)"][3] return(c(tmp_stdcor,pre_stdcor, tmp_pvalue,pre_pvalue)) } ndvi_pixellinear = app(ndvi_tmp_pre,fun_linear, cores=4) #app函数:将函数应用到每个像元 names(ndvi_pixellinear) = c( "tmp_stdcor", "pre_stdcor", "tmp_pvalue","pre_pvalue") plot(ndvi_pixellinear) writeRaster(ndvi_pixellinear, "D:/tt/ndvi_pixellinear.tif",overwrite=TRUE)有什么错误
根据你提供的代码,可能会有以下错误:
1. 没有正确加载所需的 R 包。请确保已经加载了所有需要的 R 包。
2. 文件路径不正确。请检查文件路径是否正确,并且在 Windows 系统中使用正斜杠(/)而不是反斜杠(\)。
3. 在执行函数时,需要将所需的输入参数正确传递给函数。在这种情况下,函数需要一个长度为 66 的向量,但是在您的代码中没有提供输入参数。
4. 在执行线性回归时,需要确保每个变量都有足够的数据点。在这种情况下,如果数据点的数量小于 22,则应返回 NA。
5. 在使用 `writeRaster` 函数时,需要确保输出路径和文件名正确,并且在 Windows 系统中使用正斜杠(/)而不是反斜杠(\)。
希望这些提示可以帮助您解决问题。
prob.fit <- glm.fit(x,y,family = binomial(link = "probit"))$coefficients # probit建模 logit.fit <- glm.fit(x,y,family = binomial(link = "logit"))$coefficients # logit建模 linear.fit <- glm.fit(x,y,family = gaussian(link = "identity"))$coefficients # 线性回归建模 coef.mat <- cbind(prob.fit,logit.fit,linear.fit) #改为python
在Python中,使用statsmodels库中的glm()函数可以实现类似的功能。下面是代码示例:
```python
import statsmodels.api as sm
# probit建模
probit_model = sm.GLM(y, sm.add_constant(x), family=sm.families.Binomial(link=sm.families.links.probit))
probit_fit = probit_model.fit()
prob_fit = probit_fit.params
# logit建模
logit_model = sm.GLM(y, sm.add_constant(x), family=sm.families.Binomial(link=sm.families.links.logit))
logit_fit = logit_model.fit()
logit_fit = logit_fit.params
# 线性回归建模
linear_model = sm.OLS(y, sm.add_constant(x))
linear_fit = linear_model.fit()
linear_fit = linear_fit.params
# 合并系数矩阵
coef_mat = np.column_stack((prob_fit, logit_fit, linear_fit))
```
其中,add_constant()函数用于在原始的特征矩阵x中添加一列常数项,以便拟合截距。sm.families.Binomial()表示使用二项分布作为响应变量的分布模型,link参数用于指定链接函数,probit表示使用probit函数,logit表示使用logistic函数,identity表示使用恒等函数。最后,np.column_stack()函数用于将三个系数数组按列合并成一个系数矩阵。
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