R上,如何用mgcv包添加由一组二维薄板样条函数参数化的空间光滑项
时间: 2024-09-23 18:14:51 浏览: 39
R语言mgcv包gam()函数中文帮助文档(中英文对照).doc
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在R中使用`mgcv`包添加由一组二维薄板样条函数参数化的空间光滑项,你可以使用`te()`函数。`te()`短语代表“two-dimensional tensor product smooth”,它允许你在多元模型中引入空间交互影响。以下是基本步骤:
假设你有一个名为`df`的数据框,其中包含`x`, `y`作为地理位置的列以及响应变量`yvar`。以下是添加二维薄板样条的示例:
```R
library(mgcv)
model <- gam(yvar ~ s(x, y, k = k1, by = group_column) + te(x, y, bs = "tp", k = k2),
data = df,
method = "REML", # 使用适合的空间模型优化方法,默认为REML
family = your_family_function) # 根据你的模型选择合适的分布
这里的参数解释:
- `s(x, y, k = k1, by = group_column)`:表示沿`x`和`y`方向的独立光滑曲线,`k1`是每个方向上的分段数,`group_column`是你想要根据其分组数据的列名。
- `te(x, y, bs = "tp", k = k2)`:创建一个二维光滑项,`bs = "tp"`指定了使用薄板样条(TPB),`k2`是整个光滑项的总分段数,通常是`k1^2`。
- `method = "REML"`:使用 REstricted Maximum Likelihood (REML) 方法估计模型参数,适合空间数据。
- `family = your_family_function`:替换为你的模型所需的分布家族,如`gaussian()`、`poisson()`等。
记得在使用前检查你的数据是否有缺失值,并确保`x`和`y`字段是地理坐标类型。另外,选择适当的`k`值(分段数)很重要,通常需要通过交叉验证来确定。
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