TCGA数据pearson
时间: 2024-06-12 14:09:11 浏览: 227
根据引用和引用提供的信息,TCGA数据是指从TCGA数据库中下载的乳腺癌的RNA-seq数据和临床病理资料。根据引用,HNSC rna-seq RSEM数据是指在去除了表达量为0的基因后,按照EZH2的表达量进行排序的数据。
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相关问题
tcga数据下载_TCGA数据挖掘之基因表达差异分析(视频教程)
非常感谢您的提问。我了解到您想了解关于TCGA数据下载以及基因表达差异分析的视频教程。以下是一些相关的资源和建议:
1. TCGA官网:您可以在TCGA官网上下载各种类型的数据,包括基因表达数据、临床数据等等。您需要先注册并登录才能下载数据。网站链接:https://portal.gdc.cancer.gov/
2. TCGAbiolinks:这是一个R包,可以用于从TCGA下载数据、进行预处理、差异分析等等。您可以在Bioconductor上安装这个包,并按照文档学习如何使用。链接:https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/TCGAbiolinks.html
3. Youtube:您可以在Youtube上找到很多关于TCGA数据挖掘的视频教程。例如,您可以搜索"TCGA数据分析",找到一些基础的介绍性视频。如果您想更深入地学习基因表达差异分析,您可以搜索"DESeq2"或"edgeR"等关键词,找到更专业的视频。
希望这些资源能对您有所帮助!如果您有任何其他问题,请随时提出。
tcga数据下载_单基因生信分析流程(1)一文解决TCGA数据下载整理问题
非常感谢你的提问!针对你的问题,我可以回答:
关于TCGA数据下载和单基因生信分析流程,确实有很多文章和教程可以参考。其中,比较全面和系统的一篇文章是《TCGA数据下载_单基因生信分析流程(1)》,它详细介绍了从TCGA网站下载数据、数据预处理、基因表达分析等步骤。这篇文章可以帮助初学者快速入门TCGA数据分析,并且提供了一些实用的工具和代码。
当然,除了这篇文章,还有很多其他的资源可以参考。例如,TCGA官方网站提供了大量的数据下载和分析工具,生信社区也有很多讨论和分享TCGA数据分析经验的帖子和博客。总之,只要有耐心和恒心,掌握TCGA数据分析并不是一件太困难的事情。
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