r语言tcga数据处理
时间: 2023-12-03 18:04:09 浏览: 155
TCGA原始数据预处理代码（R版|版本一）
引用和引用[2]给出了关于处理TCGA数据的两种方法。首先，可以读取表达矩阵和表型数据，然后根据需求进行数据处理和分析。表达矩阵一般可以使用edgeR包或DESeq包进行分析。如果下载的是Counts数据，需要进行normalize处理，并使用edgeR包或DESeq包进行分析。如果下载的是FPKM数据，则不能使用edgeR包，只能使用DESeq包进行处理。
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知识点详细说明：
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