CentOS7.0下LAMMPS并行安装全攻略

"这篇文档是关于在CentOS7.0操作系统上安装并行版LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）的详细步骤。LAMMPS是一款强大的分子模拟软件，适用于模拟软物质和固体物理系统，且支持多种势能模型。在Windows系统下通常也可以通过模拟器或Linux子系统进行类似安装。" 本文档提供的教程主要分为以下几个关键步骤： 1. **安装包准备**：首先，你需要下载安装包，并在Linux终端中使用`tar`命令进行解压。这里提供了一个百度网盘链接，但请注意实际操作时需要根据实际情况更新链接或寻找最新版本的安装包。 2. **安装FFTW**：FFTW是一个快速傅里叶变换库，对于LAMMPS计算非常关键。使用`yum`命令安装必要的编译工具和依赖库，然后下载FFTW源码并进行配置、编译和安装。 3. **安装MPICH**：MPICH是用于并行计算的MPI（Message Passing Interface）实现，它使得LAMMPS能够在多核处理器或分布式计算环境中运行。同样，下载源码后执行标准的`configure`、`make`和`make install`流程来安装。 4. **安装JPEG库**：LAMMPS可能需要用到JPEG库，特别是当处理包含图像数据时。按照类似FFTW和MPICH的步骤安装JPEG库。 5. **安装Voro++**：Voro++是一个计算三维空间中粒子包围盒的库，对于处理局部体积计算非常重要。如果不需要这个功能，可以跳过这一步。将Voro++源码复制到LAMMPS的特定目录，然后编译和安装。 6. **配置LAMMPS**：最后，回到LAMMPS的源代码目录，修改`lib/voronoi`下的`Makefile.lammps`，确保设置正确的Voro++的头文件和库路径。 在完成上述步骤后，你可以通过LAMMPS的`make yes-mpi`命令启用MPI支持，然后执行`make`来编译LAMMPS。为了验证安装是否成功，通常会运行一个简单的测试案例，如`make test`。 需要注意的是，这个教程适用于CentOS7.0，如果你是在Windows系统下安装，可能需要使用Linux模拟环境，如WSL（Windows Subsystem for Linux），或者在虚拟机中安装Linux发行版来完成这些步骤。此外，务必保持系统和所有依赖库的更新，以确保最佳的性能和兼容性。 在实际操作中，遇到任何问题，建议查阅LAMMPS的官方文档，或者在相关的用户论坛和社区寻求帮助，因为安装过程可能会因系统配置和软件版本的不同而有所不同。务必仔细检查每个命令和路径，避免因输入错误导致安装失败。