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首页濒危植物醉翁榆的分子亲缘关系研究:ITS与atpB-rbcL序列分析
"基于ITS、atpB-rbcL序列的醉翁榆(Ulmus gaussenii)与相近榆属植物的亲缘关系 (2011年)" 这篇论文是2011年发表在《安徽大学学报(自然科学版)》上的科研成果,主要探讨了我国特有的濒危植物醉翁榆与其所在榆属(Ulmus)中其他物种的亲缘关系。研究人员采用了分子生物学的方法,通过分析两种基因序列——内转录间隔区(ITS)和atpB-rbcL,来揭示这些植物之间的系统发育关系。 在该研究中,科研人员对24种榆属植物的atpB-rbcL基因片段进行了扩增,得到的片段长度在735至834个碱基对(bp)之间,G+C的含量保持在29.3%至31.6%之间,显示出这一基因区域的保守性。通过这些数据,他们发现醉翁榆在分子水平上与黑榆系的毛果旱榆和栓枝春榆,以及榆系中的大果榆和脱皮榆在ITS序列上有较高的相似性。 进一步分析atpB-rbcL序列,结果显示醉翁榆与榆系中的大果榆、脱皮榆及明陵榆的亲缘关系较近。此外,无论基于ITS还是atpB-rbcL序列,研究均显示醉翁榆与黑榆系的变种毛果旱榆和栓枝春榆具有较近的遗传关系。利用NJ(邻接法)和Bayesian(贝叶斯)构建的系统树完全支持了榆属内的分类结构以及榆属植物的演化关系。 这项研究的重要性在于它提供了关于濒危植物醉翁榆的遗传信息,为保护生物学提供了科学依据。通过对遗传随机性的理解,科学家可以更好地评估物种间的亲缘关系,进而制定更有效的保护策略。同时,此研究也对榆属植物的系统分类和进化历史提供了新的见解,对于植物分类学和分子系统学领域具有一定的贡献。
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2011
年
11
月
第
35
卷第
6
期
安徽大学学报(自然科学版)
Jourτlal
of
Anhui
University
(Natural Science Edition)
基于
ITS
、
atpB-rbcL
序列的醉翁榆
November
2011
Vo
l.
35
No.6
( Ulmus
gaussenii)
与相近榆属植物的亲缘关系
韩
雪智颖飘
1
*张保卫周忠泽何家庆王再岚
2
李红丽
3
李静敏
1
(1.安徽大学生命科学学院,安徽合肥
230039;2.
中国人民大学环境学院,北京
100872;
3.
北京林业大学自然保护区学院,北京
100083
)
摘
要:颜危植物保护生物学研究已成为生态学领域的研究热点之一.为了廓清我国特有濒危植物
醉翁榆
(
Ulmus
gaussenii
)与相近榆属植物的系统地位,用分子标记
I
币和
atpB-rbcL
手段分析醉翁榆与
其他榆属相关种的亲缘关系,结果表明:
24
种榆属植物
atpB-rbcL
扩增片段长度为
735
-
834
峙,
G+C
的
含量在
29.3%
- 3
1.
6%
之间,并没有发生很大的偏差;基于
ITS(
包括
5.8
s)
扩增片段,醉翁榆与黑榆系
的毛果旱榆、栓枝春榆以及榆系中的大果榆、脱皮榆
(ι
lamellosa
)相近;基于
atpB-rbcL
扩增片段,醉
翁榆与榆系中的大果榆、脱皮榆以及明陵榆的关系比较近,两种标记都表现出醉翁榆与黑榆系中变种毛
果旱榆、栓校春榆的关系比较近
;atpB-rbcL
的
NJ
和
Bayesian
树完全支持榆属组下的分类以及榆属系统
的演化关系.
关键词:醉翁榆;遗传随机性;
atpB-rbcL;
ITS;
系统树
中图分类号
:QI45;Q948
文献标志码
:A
文章编号
:1000-2162(2011)06
一 0098-10
The phylogenetic relationships between Ulmus gaussenii Cheng
and
its
dose
relatives
in
genus Ulmus based on the ITS and atpB-rbcL
HAN Xue
1
,
ZHI
Ying-biao
1
* , ZHANG Bao-wei
1
, ZHOU Zhong-ze
1
,
HE
Jia-qing
1
, WANG Zai-lan
2
,
11
Hong-li
3
,
11
Jing-min
1
(1.
School
of
Life
Science ,
Anhui
University
,
Hefei
230039
, China;
2.
School
of
Environment
and
Natural
Resources
,
Renmin
University
of
China
,
Beijing
100872
, China;
3.
College
of
Nature
Conservation
,
Beijing
ForestηUniversity
,
Beijing
100083
, China)
Abstract:
Conservation biology research of endanged
plant
has
become
popular
in
ecology area.
To
explore the systematic position of Ulmus
gα
ussenii
Cheng in genus Ulmus , the authors analyzed the
phylogenetic relationship of
U.
gα
ussenii
and
its related species
in
Ulmus
based
on
DNA sequences
of
the
chloroplase
atpB-rbcL
gene
and
the ITS region of
nuclear
ribosomal DNA.
The
sequence
of
atpB-rbcL
in
24
species
ranged from
735
to
834
and
the total
G+C
content varied from
29.
3%
to 3
1.
6%.
The phylogenetic
tree
based
on the atpB
-rbcL
data
showed that
U.
gα
ussenii
has
near
relationship with
U.
gl
α
ucescens
var.
lasioc
α
rp
α
,
U.
j
α
:p
onica
var .
suberos
α
,
U.
macroc
α
rpa
,
U.
erythroc
α
rp
α.
The phylogenetic tree
based
on
收稿日期
:2011-03-23
基金项目:中国博士后基金资助项目
(20060400551
)
;农业部草地开放实验室基金资助项目;安徽大学人才引进基金
资助项目
(06124
,
204033)
作者简介:韩
雪(
1985
一)
,女,安徽池州人,安徽大学硕士研究生*智颖飘(通讯作者)
,安徽大学教授,硕士生
导师,
E-mail:
zhiyingbiao@gmai
l.
com.
引文格式:韩雪,智颖飘,张保卫,等.基于
ITS
,
atpB-rbcL
序列的醉翁榆
(
Ulmus
gaussenii)
与相近榆属植物的亲缘关
系
[JJ.
安徽大学学报:自然科学版,
2011
,
35(6)
:98
一
107.
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