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R语言函数包入门指南:安装与实战
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更新于2024-07-19
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R语言是一种广泛应用于统计计算的开源编程语言,以其强大的数据处理和分析能力而闻名。这个学习手册主要涵盖了R语言的基础知识和核心函数包的学习,旨在帮助用户更有效地利用R进行各种数据分析任务。
首先,我们关注的是"Base Package"(基础包),这是R语言的标准库,包含了基础的数据类型、数学运算、绘图和统计功能。当你开始使用R时,无需安装额外的包就能访问这些基本工具。例如,`.bincode`部分可能涉及到二进制编码的处理,这对于数据存储和传输时的效率优化至关重要。`.Device`则可能涉及不同类型的输出设备,如屏幕、图形文件等,让数据可视化更具灵活性。
`Machine`章节关注的是R语言与特定计算机硬件的交互,可能包括操作系统兼容性、CPU特性以及内存管理。理解这些内容有助于确保程序在不同平台上的一致性和性能优化。
`.Pla`可能指的是`Platform`,这部分内容通常会介绍R运行的具体环境,包括编译器、硬件架构和其他系统特性的详细信息。
在学习过程中,通过查阅文档中的代码示例,用户可以深入了解如何使用这些基础函数和包。例如,如何读取和写入数据、如何执行基本的统计分析、如何创建和修改数据结构(如向量、列表、数据框等)、如何绘制图表以及如何进行调试和错误处理。
R语言的核心优势在于其丰富的扩展性。通过加载更多的函数包,用户可以扩展其功能,涵盖机器学习、时间序列分析、网络分析等多个领域。每个函数包都有自己的描述和文档,以便用户根据具体需求选择和学习。比如,`ggplot2`包用于高级数据可视化,`dplyr`和`tidyverse`提供数据操作和清洗的功能,而`caret`和`mlr`则支持机器学习模型的构建和评估。
在学习R语言函数包时,理解版本管理和依赖管理也十分重要。R Core Team维护了R的官方版本,并鼓励遵循GNU General Public License(GPL)进行软件共享。随着新版本的发布,可能会有新的功能和改进,因此定期检查更新和学习新包是保持技能与时俱进的关键。
R语言函数包学习手册提供了从基础操作到高级应用的全面指南,无论是初学者还是经验丰富的用户,都能从中找到所需的资源和指导,提升数据分析和科学计算的能力。
CONTENTS xv
valid.just . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 971
validDetails . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 971
vpPath . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 972
widthDetails . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 973
Working with Viewports . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 974
xDetails . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 976
xsplinePoints . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 977
7 The methods package 979
methods-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 979
.BasicFunsList . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 980
as . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 980
BasicClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 984
callGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 986
callNextMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 987
canCoerce . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 989
cbind2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 990
Classes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 991
classesToAM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 994
className . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 996
classRepresentation-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 998
Documentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 999
dotsMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1000
environment-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1003
envRefClass-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1004
evalSource . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1005
findClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1008
findMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1009
fixPre1.8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1012
genericFunction-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1013
GenericFunctions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1014
getClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1017
getMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1019
getPackageName . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1021
hasArg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1022
implicitGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1023
inheritedSlotNames . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1025
initialize-methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1026
is . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1027
isSealedMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1032
language-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1034
LinearMethodsList-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1034
LocalReferenceClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1035
makeClassRepresentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1036
method.skeleton . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1038
MethodDefinition-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1039
Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1040
MethodsList-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1047
MethodWithNext-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1048
new . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1049
nonStructure-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1051
ObjectsWithPackage-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1052
promptClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1053
xvi CONTENTS
promptMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1054
ReferenceClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1055
representation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1064
S3Part . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1066
S4groupGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1069
SClassExtension-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1071
selectSuperClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1072
setClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1073
setClassUnion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1077
setGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1079
setLoadActions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1084
setMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1086
setOldClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1089
show . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1094
showMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1095
signature-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1097
slot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1098
StructureClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1100
testInheritedMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1102
TraceClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1103
validObject . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1104
8 The parallel package 1107
parallel-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1107
clusterApply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1108
detectCores . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1111
makeCluster . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1112
mclapply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1113
RNGstreams . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1115
splitIndices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1116
9 The splines package 1117
splines-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1117
asVector . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1117
backSpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1118
bs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1119
interpSpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1120
ns . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1121
periodicSpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1122
polySpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1123
predict.bs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1124
predict.bSpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1125
splineDesign . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1126
splineKnots . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1128
splineOrder . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1128
xyVector . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1129
10 The stats package 1131
stats-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1131
.checkMFClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1131
acf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1132
acf2AR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1134
add1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1135
CONTENTS xvii
addmargins . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1137
aggregate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1139
AIC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1142
alias . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1143
anova . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1145
anova.glm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1145
anova.lm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1147
anova.mlm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1148
ansari.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1150
aov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1153
approxfun . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1154
ar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1156
ar.ols . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1159
arima . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1161
arima.sim . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1165
arima0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1166
ARMAacf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1169
ARMAtoMA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1171
as.hclust . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1171
asOneSidedFormula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1172
ave . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1173
bandwidth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1174
bartlett.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1175
Beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1177
binom.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1179
Binomial . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1180
biplot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1182
biplot.princomp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1183
birthday . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1185
Box.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1186
C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1187
cancor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1188
case+variable.names . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1190
Cauchy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1191
chisq.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1192
Chisquare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1194
cmdscale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1197
coef . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1199
complete.cases . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1200
confint . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1201
constrOptim . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1202
contrast . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1204
contrasts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1205
convolve . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1206
cophenetic . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1208
cor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1209
cor.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1212
cov.wt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1215
cpgram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1216
cutree . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1217
decompose . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1218
delete.response . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1220
xviii CONTENTS
dendrapply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1221
dendrogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1222
density . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1226
deriv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1230
deviance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1232
df.residual . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1233
diffinv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1234
dist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1235
Distributions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1238
dummy.coef . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1239
ecdf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1240
eff.aovlist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1242
effects . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1243
embed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1245
expand.model.frame . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1245
Exponential . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1246
extractAIC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1248
factanal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1249
factor.scope . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1253
family . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1254
FDist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1257
fft . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1259
filter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1260
fisher.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1261
fitted . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1264
fivenum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1265
fligner.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1266
formula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1267
formula.nls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1269
friedman.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1270
ftable . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1272
ftable.formula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1274
GammaDist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1275
Geometric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1277
getInitial . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1279
glm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1280
glm.control . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1285
glm.summaries . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1286
hclust . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1287
heatmap . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1290
HoltWinters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1293
Hypergeometric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1295
identify.hclust . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1297
influence.measures . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1298
integrate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1301
interaction.plot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1303
IQR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1305
is.empty.model . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1306
isoreg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1307
KalmanLike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1308
kernapply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1310
kernel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1311
CONTENTS xix
kmeans . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1312
kruskal.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1315
ks.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1316
ksmooth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1319
lag . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1320
lag.plot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1321
line . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1322
lm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1323
lm.fit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1326
lm.influence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1328
lm.summaries . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1329
loadings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1331
loess . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1332
loess.control . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1334
Logistic . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1335
logLik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1336
loglin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1338
Lognormal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1340
lowess . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1341
ls.diag . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1342
ls.print . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1343
lsfit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1344
mad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1345
mahalanobis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1346
make.link . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1347
makepredictcall . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1348
manova . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1349
mantelhaen.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1350
mauchly.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1353
mcnemar.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1354
median . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1355
medpolish . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1356
model.extract . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1358
model.frame . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1359
model.matrix . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1361
model.tables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1362
monthplot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1364
mood.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1366
Multinom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1367
na.action . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1368
na.contiguous . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1369
na.fail . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1370
naprint . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1371
naresid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1371
NegBinomial . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1372
nextn . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1374
nlm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1375
nlminb . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1377
nls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1380
nls.control . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1385
NLSstAsymptotic . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1386
NLSstClosestX . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1387
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