CYP19A基因调控牙鲆卵巢发育:表观遗传的新见解

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本研究聚焦于CYP19A基因在牙鲆(Paralichthys olivaceus)卵巢发育周期中的表观遗传调控作用,由丁玉霞、何峰等学者合作完成,发表在《中国科技论文在线》上。他们以成年雌性牙鲆为研究对象,通过荧光实时定量方法对性腺中P450aromA(CYP19A)酶基因的表达进行了深入分析。CYP19A酶在鱼类卵巢发育过程中扮演着关键角色,它被认为参与雌激素的合成,对卵母细胞的成熟具有促进作用。 研究人员特别关注了CYP19A基因启动子区的CpG富集区域,这是一种DNA甲基化的热点区域。他们利用重亚硫酸氢盐修饰后测序法,对这些CpG位点的甲基化模式进行了测定。结果显示,CYP19A基因的表达随卵巢发育阶段的变化呈现规律性波动,其表达量在卵巢发育的IV期达到峰值,随后下降至初期水平。然而,启动子区CpG富集区的甲基化水平则呈现出与之相反的趋势,即在发育后期甲基化程度较高,而在早期较低。 这些发现暗示了CYP19A基因的表达可能受到启动子区CpG甲基化状态的影响,这是表观遗传学调控的一种方式。表观遗传学调控是指基因表达水平的改变并不依赖于DNA序列的改变,而是通过如DNA甲基化、组蛋白修饰等机制调控基因的活性。这项研究为理解CYP19A基因在牙鲆卵巢发育过程中的具体功能以及其表达调控的分子机制提供了初步见解。 此外,研究还得到了高等学校博士学科点专项新教师基金的支持,作者丁玉霞专注于鱼类繁殖生理与表观遗传学的研究,而通讯联系人何峰则作为指导老师,进一步探讨了这一领域的前沿问题。该研究的关键词包括牙鲆、DNA甲基化、CYP19A基因、基因表达以及启动子,表明研究内容紧密围绕这些生物学核心概念展开。 这篇首发论文揭示了CYP19A基因在牙鲆卵巢发育中表观遗传调控的重要性,为鱼类繁殖生物学和表观遗传调控机制提供了新的科学依据,对于鱼类养殖业及生物医学领域都具有重要的理论价值和实践意义。

python 根据文件“Molecular_Descriptor.xlsx”和“ERα_activity.xlsx”提供的数据,针对1974个化合物的729个分子描述符进行变量选择,根据变量对生物活性影响的重要性进行排序,并给出前20个对生物活性最具有显著影响的分子描述符(即变量),并请详细说明分子描述符筛选过程及其合理性。 问题2. 请结合问题1,选择不超过20个分子描述符变量,构建化合物对ERα生物活性的定量预测模型,请叙述建模过程。然后使用构建的预测模型,对文件“ERα_activity.xlsx”的test表中的50个化合物进行IC50值和对应的pIC50值预测,并将结果分别填入“ERα_activity.xlsx”的test表中的IC50_nM列及对应的pIC50列。 问题3. 请利用文件“Molecular_Descriptor.xlsx”提供的729个分子描述符,针对文件“ADMET.xlsx”中提供的1974个化合物的ADMET数据,从五个指标(Caco-2、CYP3A4、hERG、HOB、MN)中任选2个,分别构建其分类预测模型,并简要叙述建模过程。然后使用所构建的2个分类预测模型,对文件“ADMET.xlsx”的test表中的50个化合物进行相应的预测,并将结果填入“ADMET.xlsx”的test表中对应的Caco-2、CYP3A4、hERG、HOB、MN列。 问题4(选做). 寻找并阐述化合物的哪些分子描述符,以及这些分子描述符在什么取值或者处于什么取值范围时,能够使化合物对抑制ERα具有更好的生物活性,同时具有更好的ADMET性质(给定的五个ADMET性质中,至少三个性质较好)。

2023-06-10 上传