基于Bolasso算法的高维特征选取与预测技术

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资源摘要信息:"Bolasso特征选择预测程序集" Bolasso算法是一种用于特征选择和预测的统计方法,其名称来源于Bootstrap和Lasso两种技术的结合。该算法主要适用于高维数据集中的特征选择,能够有效处理在高维空间中常见的过拟合问题。 Francis R. Bach是算法的主要提出者之一,他与同事一起在统计学习领域做出了重要贡献。Bolasso算法的提出,为高维数据特征选择问题提供了新的解决途径。 Bolasso算法核心思路是将Bootstrap自助法和Lasso回归结合起来。自助法是一种重采样技术,通过有放回地从原始数据集中抽取观测值,构造多个不同的训练数据集。Lasso(Least Absolute Shrinkage and Selection Operator)是一种回归分析方法,它通过在损失函数中加入L1正则化项来实现特征选择和模型压缩。 在Bolasso中,首先对原始数据集进行多次自助抽样,每次抽取得到一个新的训练数据集。然后在每个训练数据集上运行Lasso回归,得到一系列特征选择结果。这些结果中频繁被选择的特征被认定为重要特征。 Bolasso特征选择算法的实现通常涉及到如下几个关键步骤: 1. 自助抽样:从原始数据集中有放回地抽取样本来生成多个训练集。 2. Lasso回归:在每个训练集上应用Lasso回归进行特征选择。 3. 特征聚合:统计所有训练集上选择的特征频率,频率高的特征被选为最终模型的一部分。 Bolasso算法使用了Karl Skoglund实现的lars算法,这是一种用于求解Lasso问题的算法,能够高效地处理大规模数据集。lars算法的全称是Least Angle Regression,它利用了Lasso问题的几何性质,通过逐步选取变量,逐步逼近最优解。 本程序集中包含了多个文件,这些文件构成了Bolasso算法在特定编程环境(可能是MATLAB)中的实现。各文件功能简介如下: - bolasso.m:Bolasso算法的主函数,负责调用其他子函数并执行特征选择过程。 - process_options.m:处理输入参数的函数,可能包含了算法运行时所需的配置选项。 - synthesizeData.m:生成模拟数据的函数,用于测试算法或演示算法效果。 - Kfold.m:实现了K折交叉验证的函数,用于评估模型的泛化能力。 - bolassoSimpleDemo.m:提供了一个简单的演示,通过这个演示可以直观地了解Bolasso算法的应用。 - setSeed.m 和 restoreSeed.m:这两个文件可能用于生成可复现的随机数序列,保证实验结果的一致性。 Bolasso算法在机器学习、统计分析和数据挖掘等领域有着广泛的应用,特别是在处理基因组学、蛋白质组学和脑成像等领域的高维数据时表现出色。通过有效地降低特征空间的维度,Bolasso算法有助于提高模型的泛化能力,减少计算复杂度,并揭示数据中的潜在结构。

请帮我翻译每一句代码:def parse_opt(): parser = argparse.ArgumentParser() parser.add_argument('--weights', nargs='+', type=str, default='D://Net//pytorch//yolov5-master//yolov5-master//runs//train//exp3//weights//best.pt', help='model path or triton URL') parser.add_argument('--source', type=str, default=ROOT / 'data/images', help='file/dir/URL/glob/screen/0(webcam)') parser.add_argument('--data', type=str, default=ROOT / 'data/coco128.yaml', help='(optional) dataset.yaml path') parser.add_argument('--imgsz', '--img', '--img-size', nargs='+', type=int, default=[480], help='inference size h,w') parser.add_argument('--conf-thres', type=float, default=0.25, help='confidence threshold') parser.add_argument('--iou-thres', type=float, default=0.45, help='NMS IoU threshold') parser.add_argument('--max-det', type=int, default=1000, help='maximum detections per image') parser.add_argument('--device', default='', help='cuda device, i.e. 0 or 0,1,2,3 or cpu') parser.add_argument('--view-img', action='store_true', help='show results') parser.add_argument('--save-txt', action='store_true', help='save results to *.txt') parser.add_argument('--save-conf', action='store_true', help='save confidences in --save-txt labels') parser.add_argument('--save-crop', action='store_true', help='save cropped prediction boxes') parser.add_argument('--nosave', action='store_true', help='do not save images/videos') parser.add_argument('--classes', nargs='+', type=int, help='filter by class: --classes 0, or --classes 0 2 3') parser.add_argument('--agnostic-nms', action='store_true', help='class-agnostic NMS') parser.add_argument('--augment', action='store_true', help='augmented inference') parser.add_argument('--visualize', action='store_true', help='visualize features')

2023-05-11 上传

import time import tensorflow.compat.v1 as tf tf.disable_v2_behavior() from tensorflow.examples.tutorials.mnist import input_data import mnist_inference import mnist_train tf.compat.v1.reset_default_graph() EVAL_INTERVAL_SECS = 10 def evaluate(mnist): with tf.Graph().as_default() as g: #定义输入与输出的格式 x = tf.compat.v1.placeholder(tf.float32, [None, mnist_inference.INPUT_NODE], name='x-input') y_ = tf.compat.v1.placeholder(tf.float32, [None, mnist_inference.OUTPUT_NODE], name='y-input') validate_feed = {x: mnist.validation.images, y_: mnist.validation.labels} #直接调用封装好的函数来计算前向传播的结果 y = mnist_inference.inference(x, None) #计算正确率 correcgt_prediction = tf.equal(tf.argmax(y, 1), tf.argmax(y_, 1)) accuracy = tf.reduce_mean(tf.cast(correcgt_prediction, tf.float32)) #通过变量重命名的方式加载模型 variable_averages = tf.train.ExponentialMovingAverage(0.99) variable_to_restore = variable_averages.variables_to_restore() saver = tf.train.Saver(variable_to_restore) #每隔10秒调用一次计算正确率的过程以检测训练过程中正确率的变化 while True: with tf.compat.v1.Session() as sess: ckpt = tf.train.get_checkpoint_state(minist_train.MODEL_SAVE_PATH) if ckpt and ckpt.model_checkpoint_path: #load the model saver.restore(sess, ckpt.model_checkpoint_path) global_step = ckpt.model_checkpoint_path.split('/')[-1].split('-')[-1] accuracy_score = sess.run(accuracy, feed_dict=validate_feed) print("After %s training steps, validation accuracy = %g" % (global_step, accuracy_score)) else: print('No checkpoint file found') return time.sleep(EVAL_INTERVAL_SECS) def main(argv=None): mnist = input_data.read_data_sets(r"D:\Anaconda123\Lib\site-packages\tensorboard\mnist", one_hot=True) evaluate(mnist) if __name__ == '__main__': tf.compat.v1.app.run()对代码进行改进

2023-05-26 上传

import numpy as np class Node: j = None theta = None p = None left = None right = None class DecisionTreeBase: def __init__(self, max_depth, feature_sample_rate, get_score): self.max_depth = max_depth self.feature_sample_rate = feature_sample_rate self.get_score = get_score def split_data(self, j, theta, X, idx): idx1, idx2 = list(), list() for i in idx: value = X[i][j] if value <= theta: idx1.append(i) else: idx2.append(i) return idx1, idx2 def get_random_features(self, n): shuffled = np.random.permutation(n) size = int(self.feature_sample_rate * n) selected = shuffled[:size] return selected def find_best_split(self, X, y, idx): m, n = X.shape best_score = float("inf") best_j = -1 best_theta = float("inf") best_idx1, best_idx2 = list(), list() selected_j = self.get_random_features(n) for j in selected_j: thetas = set([x[j] for x in X]) for theta in thetas: idx1, idx2 = self.split_data(j, theta, X, idx) if min(len(idx1), len(idx2)) == 0 : continue score1, score2 = self.get_score(y, idx1), self.get_score(y, idx2) w = 1.0 * len(idx1) / len(idx) score = w * score1 + (1-w) * score2 if score < best_score: best_score = score best_j = j best_theta = theta best_idx1 = idx1 best_idx2 = idx2 return best_j, best_theta, best_idx1, best_idx2, best_score def generate_tree(self, X, y, idx, d): r = Node() r.p = np.average(y[idx], axis=0) if d == 0 or len(idx)<2: return r current_score = self.get_score(y, idx) j, theta, idx1, idx2, score = self.find_best_split(X, y, idx) if score >= current_score: return r r.j = j r.theta = theta r.left = self.generate_tree(X, y, idx1, d-1) r.right = self.generate_tree(X, y, idx2, d-1) return r def fit(self, X, y): self.root = self.generate_tree(X, y, range(len(X)), self.max_depth) def get_prediction(self, r, x): if r.left == None and r.right == None: return r.p value = x[r.j] if value <= r.theta: return self.get_prediction(r.left, x) else: return self.get_prediction(r.right, x) def predict(self, X): y = list() for i in range(len(X)): y.append(self.get_prediction(self.root, X[i])) return np.array(y)

2023-06-08 上传
2023-05-26 上传