棉花全基因组WRKY转录因子鉴定与表达特性揭示

本研究论文标题为"棉花全基因组WRKY转录因子的鉴定与表达分析"，由戴鹤、张艳等研究人员共同完成。WRKY转录因子在植物基因组中扮演着关键角色，它们参与多种生理生化过程，对植物的生长发育和应对外界压力如病害具有重要作用。作者团队利用了最新的生物信息学技术，结合棉花全基因组数据、转录组测序以及实时定量聚合酶链反应（Real-Time PCR）实验，对棉花基因组中的WRKY家族进行全面剖析。 首先，通过对棉花全基因组的深入挖掘，研究人员鉴定出1011个WRKY基因，其中101个属于标准型，9个为非标准类型，这展示了WRKY基因家族的多样性。基因重复分析揭示了棉花WRKY基因家族中的12次重复事件，涉及到29个基因，占总WRKY基因的26%，显示出其在基因组中的重要位置和可能的功能模块化。 在染色体定位方面，发现棉花WRKY基因在染色体上的分布并不均匀，存在三个基因簇，这可能反映了这些基因在进化过程中的动态分布和功能分区。通过转录组表达分析，研究者观察到黄萎病菌侵染后的响应模式：44个WRKY基因上调表达，可能是参与抵御病害的关键因子；15个基因下调，可能与免疫反应或保护机制有关；其余14个成员的表达呈先降后升趋势，3个则表现为先升后降，而22个成员的表达波动频繁，可能与更复杂的调控网络有关。 这项研究不仅提供了棉花WRKY基因家族的全面基因组视图，还为进一步探讨这些基因的功能特性、调控网络以及它们在棉花对抗黄萎病等病害过程中的作用提供了宝贵的基础数据。关键词包括棉花、WRKY基因、系统进化、黄萎病菌以及基因表达，表明了研究的焦点集中在这些生物学关键点上。该研究成果对于棉花遗传改良和病虫害防控策略的制定具有重要意义。