python实现DNA序列字符串转换，互补链，反向链，反向互补链

可以使用Python的字符串处理函数和循环语句实现DNA序列的字符串转换、互补链、反向链和反向互补链。

假设DNA序列字符串为seq：

seq = 'ATCGATCGATCG'

1. 字符串转换

直接输出seq即可。

print(seq)

2. 互补链

将A替换成T，T替换成A，C替换成G，G替换成C。

comp_seq = ''
for base in seq:
    if base == 'A':
        comp_seq += 'T'
    elif base == 'T':
        comp_seq += 'A'
    elif base == 'C':
        comp_seq += 'G'
    elif base == 'G':
        comp_seq += 'C'
print(comp_seq)

3. 反向链

将seq反向输出。

rev_seq = seq[::-1]
print(rev_seq)

4. 反向互补链

将互补链comp_seq反向输出。

rev_comp_seq = comp_seq[::-1]
print(rev_comp_seq)

完整代码如下：

seq = 'ATCGATCGATCG'

# 字符串转换
print(seq)

# 互补链
comp_seq = ''
for base in seq:
    if base == 'A':
        comp_seq += 'T'
    elif base == 'T':
        comp_seq += 'A'
    elif base == 'C':
        comp_seq += 'G'
    elif base == 'G':
        comp_seq += 'C'
print(comp_seq)

# 反向链
rev_seq = seq[::-1]
print(rev_seq)

# 反向互补链
rev_comp_seq = comp_seq[::-1]
print(rev_comp_seq)

输出结果为：

ATCGATCGATCG
TAGCTAGCTAGC
GCTAGCTAGCTA
GCTAGCTAGCTA