r语言已知距离矩阵,使用最短距离法进行谱系聚类,并画出谱系图
时间: 2024-03-03 19:53:36 浏览: 171
聚类分析算法解析.pdf
好的,我来回答你的问题。
首先,我们可以使用 `hclust` 函数对距离矩阵进行谱系聚类。 `hclust` 函数可以根据距离矩阵的信息进行聚类,并返回一个聚类树。最短距离法也称为单连接法,它是 `hclust` 函数的默认聚类算法。
下面是一个使用最短距离法进行谱系聚类的示例代码:
```R
# 假设距离矩阵为 dist_mat
hc <- hclust(as.dist(dist_mat), method = "single")
```
其中 `as.dist` 函数将距离矩阵转换为距离对象,`method` 参数指定了聚类算法,这里使用了最短距离法。
接下来,我们可以使用 `plot` 函数画出谱系图。谱系图可以帮助我们可视化聚类树的结构,更好地理解聚类结果。
```R
plot(hc)
```
这将绘制出一个谱系图,其中每个叶子节点代表一个观测值,较低的节点表示较紧密的聚类,而较高的节点表示较松散的聚类。
希望这个回答能够帮助到你!
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