test_preds = np.zeros((test_df.shape[0],2)) for i in range(5): test_preds[:, 0] += weights[i] * final_test_predictions[i][:, 0] test_preds[:, 1] += weights[i] * final_test_predictions[i][:, 1] test_preds /= sum(weights) test_preds

时间: 2023-12-17 14:04:21 浏览: 82
这段代码是用来计算测试集上的预测概率的加权平均值。首先,初始化一个全零矩阵test_preds,其形状为(test_df.shape[0], 2),其中test_df.shape[0]表示测试集样本的数量。然后,对于每一折的预测结果final_test_predictions[i],将其第一列与第二列分别乘以对应的权重weights[i],并累加到test_preds的对应列中。最后,将test_preds除以权重和sum(weights),得到加权平均后的预测概率。最终的test_preds是一个形状为(test_df.shape[0], 2)的矩阵,其中每一行表示一个样本在两个类别上的预测概率。
相关问题

这段程序的功能? for subject_id, model_file in personalised_cps.items(): model = torch.load(model_file, map_location=config.device) subj_dev_labels, subj_dev_preds = get_predictions(model=model, task=PERSONALISATION, data_loader=id2data_loaders[subject_id]['devel'], use_gpu=use_gpu) all_dev_labels.append(subj_dev_labels) all_dev_preds.append(subj_dev_preds) all_dev_ids.extend([subject_id]*subj_dev_labels.shape[0]) subj_test_labels, subj_test_preds = get_predictions(model=model, task=PERSONALISATION, data_loader=id2data_loaders[subject_id]['test'], use_gpu=use_gpu) all_test_labels.append(subj_test_labels) all_test_preds.append(subj_test_preds) all_test_ids.extend([subject_id]*subj_test_labels.shape[0]) all_dev_labels = np.concatenate(all_dev_labels) all_dev_preds = np.concatenate(all_dev_preds) all_test_labels = np.concatenate(all_test_labels) all_test_preds = np.concatenate(all_test_preds)

这段程序的功能是进行个性化推荐的模型评估。首先,它遍历一个包含个性化模型文件路径的字典 personalized_cps,通过使用torch.load加载模型,并在指定设备上进行评估。对于每个模型,它会将开发集和测试集的真实标签和预测值存储在相应的数组 all_dev_labels、all_dev_preds、all_test_labels 和 all_test_preds 中,同时将子主题的 id 存储在 all_dev_ids 和 all_test_ids 中。最后,它使用 numpy.concatenate 将所有主题的标签和预测值合并成一个数组,以便进行后续的模型评估。

def _pred(sentence, temperature=1): if len(sentence) < max_len: print('in def _pred,length error ') return sentence = sentence[-max_len:] x_pred = np.zeros((1, max_len, len(words))) for t, char in enumerate(sentence): x_pred[0, t, word2numF(char)] = 1. preds = model.predict(x_pred, verbose=0)[0] preds = np.asarray(preds).astype('float64') exp_preds = np.power(preds, temperature) # 计算所有备选输出文字概率`preds`的`temperature`次方 preds = exp_preds / np.sum(exp_preds) # 重新统计概率分布 pro = np.random.choice(range(len(preds)), 1, p=preds) # 根据新概率随机选择候选文字 next_index = int(pro.squeeze()) next_char = num2word[next_index] return next_char

这段代码是一个用于生成文本的函数 `_pred`,它接受一个字符串 `sentence` 和一个温度参数 `temperature` 作为输入,返回一个字符作为输出。这个函数的实现基于一个训练好的模型,并利用该模型对给定的 `sentence` 进行预测,得到下一个字符的概率分布。然后,使用温度参数 `temperature` 对概率分布进行调节,加入一定的随机性,最后根据新的概率分布随机选择一个候选字符作为输出,并将其返回。
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def train(model, train_loader, criterion, optimizer): model.train() train_loss = 0.0 train_acc = 0.0 for i, (inputs, labels) in enumerate(train_loader): optimizer.zero_grad() outputs = model(inputs.unsqueeze(1).float()) loss = criterion(outputs, labels.long()) loss.backward() optimizer.step() train_loss += loss.item() * inputs.size(0) _, preds = torch.max(outputs, 1) train_acc += torch.sum(preds == labels.data) train_loss = train_loss / len(train_loader.dataset) train_acc = train_acc.double() / len(train_loader.dataset) return train_loss, train_acc def test(model, verify_loader, criterion): model.eval() test_loss = 0.0 test_acc = 0.0 with torch.no_grad(): for i, (inputs, labels) in enumerate(test_loader): outputs = model(inputs.unsqueeze(1).float()) loss = criterion(outputs, labels.long()) test_loss += loss.item() * inputs.size(0) _, preds = torch.max(outputs, 1) test_acc += torch.sum(preds == labels.data) test_loss = test_loss / len(test_loader.dataset) test_acc = test_acc.double() / len(test_loader.dataset) return test_loss, test_acc # Instantiate the model model = CNN() # Define the loss function and optimizer criterion = nn.CrossEntropyLoss() optimizer = optim.Adam(model.parameters(), lr=0.001) # Instantiate the data loaders train_dataset = MyDataset1('1MATRICE') train_loader = DataLoader(train_dataset, batch_size=5, shuffle=True) test_dataset = MyDataset2('2MATRICE') test_loader = DataLoader(test_dataset, batch_size=5, shuffle=False) train_losses, train_accs, test_losses, test_accs = [], [], [], [] for epoch in range(500): train_loss, train_acc = train(model, train_loader, criterion, optimizer) test_loss, test_acc = test(model, test_loader, criterion) train_losses.append(train_loss) train_accs.append(train_acc) test_losses.append(test_loss) test_accs.append(test_acc) print('Epoch: {} Train Loss: {:.4f} Train Acc: {:.4f} Test Loss: {:.4f} Test Acc: {:.4f}'.format( epoch, train_loss, train_acc, test_loss, test_acc))

#导入所需库 import numpy as np import pandas as pd from sklearn.preprocessing import LabelEncoder from keras.utils import to_categorical from keras.models import Sequential from keras.layers import Dense from sklearn.model_selection import KFold #读入数据 train_data = pd.read_csv('ProSeqs_Train.txt', delimiter=' ', header=None) test_data = pd.read_csv('ProSeqs_Test.txt', delimiter=' ', header=None) #预处理训练集数据 X = train_data.iloc[:, 2:].values y = train_data.iloc[:, 1].values le = LabelEncoder() y = le.fit_transform(y) y = to_categorical(y) #定义模型 model = Sequential() model.add(Dense(64, input_dim=X.shape[1], activation='relu')) model.add(Dense(32, activation='relu')) model.add(Dense(2, activation='softmax')) model.compile(loss='categorical_crossentropy', optimizer='adam', metrics=['accuracy']) #K折交叉验证训练模型 kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) fold_scores = [] for train_index, valid_index in kf.split(X): train_X, train_y = X[train_index], y[train_index] valid_X, valid_y = X[valid_index], y[valid_index] model.fit(train_X, train_y, validation_data=(valid_X, valid_y), epochs=50, batch_size=32, verbose=2) fold_scores.append(model.evaluate(valid_X, valid_y, verbose=0)[1]) print('KFold cross-validation accuracy: {:.2f}%'.format(np.mean(fold_scores) * 100)) #预处理测试集数据 test_X = test_data.iloc[:, 1:].values #预测测试集结果 preds = model.predict(test_X) preds = np.argmax(preds, axis=1) #保存预测结果至文件中 np.savetxt('preds.txt', preds, fmt='%d') #输出预测结果 print('Predictions:') print(preds)该蛋白质功能预测实验涉及分类模型的理论基础

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