如何用R代码绘制横坐标为lambd,纵坐标为Prediction error的图?
时间: 2024-02-22 10:59:52 浏览: 62
您可以使用R中的ggplot2包来绘制这样的图,下面是一段示例代码:
```R
library(ggplot2)
# 创建一个数据框
df <- data.frame(
lambda = c(0.1, 0.2, 0.3, 0.4, 0.5),
error = c(0.05, 0.03, 0.02, 0.02, 0.01)
)
# 绘制散点图
ggplot(df, aes(x = lambda, y = error)) +
geom_point() +
xlab("lambd") +
ylab("Prediction error")
```
这将创建一个散点图,其中横坐标为`lambda`,纵坐标为`Prediction error`。您可以根据需要调整代码中的数据和标签。
相关问题
请准确无误地写出R语言代码完成以下任务:①生成50×30的随机数据集和30个变量;②要生成三组线性模型的①,且这三组原始模型的系数不同;③(线性回归)分别计算这三组的CV值;④(岭回归)分别对这三组,分别画出在岭回归下横坐标为lambd,纵坐标为CV error或Prediction error的图;⑤基于一倍标准差准则给出参数值上限
以下是R语言代码,完成以上任务:
1. 生成50x30的随机数据集和30个变量:
```
data <- matrix(rnorm(50*30), nrow = 50)
```
2. 生成三组线性模型:
```
# 第一组
set.seed(123)
X1 <- data[,1:29]
Y1 <- X1[,1] + X1[,2] + X1[,3] + rnorm(50)
fit1 <- lm(Y1 ~ X1)
# 第二组
set.seed(456)
X2 <- data[,1:29]
Y2 <- 2*X2[,1] + 3*X2[,2] + X2[,3] + rnorm(50)
fit2 <- lm(Y2 ~ X2)
# 第三组
set.seed(789)
X3 <- data[,1:29]
Y3 <- 4*X3[,1] - 2*X3[,2] + 3*X3[,3] + rnorm(50)
fit3 <- lm(Y3 ~ X3)
```
3. 计算线性回归的CV值:
```
library(boot)
# 第一组
cv.fit1 <- cv.glm(data, fit1, K = 10)
cv.error1 <- cv.fit1$delta
# 第二组
cv.fit2 <- cv.glm(data, fit2, K = 10)
cv.error2 <- cv.fit2$delta
# 第三组
cv.fit3 <- cv.glm(data, fit3, K = 10)
cv.error3 <- cv.fit3$delta
```
4. 在岭回归下,分别对这三组数据画出横坐标为lambda,纵坐标为CV error的图:
```
library(glmnet)
# 第一组
cv.ridge1 <- cv.glmnet(X1, Y1, alpha = 0, nfolds = 10)
plot(cv.ridge1)
# 第二组
cv.ridge2 <- cv.glmnet(X2, Y2, alpha = 0, nfolds = 10)
plot(cv.ridge2)
# 第三组
cv.ridge3 <- cv.glmnet(X3, Y3, alpha = 0, nfolds = 10)
plot(cv.ridge3)
```
5. 基于一倍标准差准则给出参数值上限:
```
# 第一组
upper1 <- coef(fit1) + sd(resid(fit1)) * qt(0.975, df = fit1$df.residual)
# 第二组
upper2 <- coef(fit2) + sd(resid(fit2)) * qt(0.975, df = fit2$df.residual)
# 第三组
upper3 <- coef(fit3) + sd(resid(fit3)) * qt(0.975, df = fit3$df.residual)
```
其中,`coef()`函数用于提取线性模型的系数,`resid()`函数用于提取线性模型的残差,`sd()`函数用于计算标准差,`qt()`函数用于计算t分布的分位数。可以根据需要调整图像参数。
基于以下代码:# ①建立50×30的随机数据和30个变量 set.seed(123) X <- matrix(rnorm(50*30), ncol=30) y <- rnorm(50) # ②生成三组不同系数的线性模型 beta1 <- rnorm(30, mean=1, sd=0.5) beta2 <- rnorm(30, mean=2, sd=0.5) beta3 <- rnorm(30, mean=3, sd=0.5) # 定义一个函数用于计算线性回归的CV值 cv_linear <- function(X, y, k=10, lambda=NULL) { n <- nrow(X) if (is.null(lambda)) { lambda <- seq(0, 1, length.out=100) } mse <- rep(0, length(lambda)) folds <- sample(rep(1:k, length.out=n)) for (i in 1:k) { X_train <- X[folds!=i, ] y_train <- y[folds!=i] X_test <- X[folds==i, ] y_test <- y[folds==i] for (j in 1:length(lambda)) { fit <- glmnet(X_train, y_train, alpha=0, lambda=lambda[j]) y_pred <- predict(fit, newx=X_test) mse[j] <- mse[j] + mean((y_test - y_pred)^2) } } mse <- mse / k return(mse) } # ③(线性回归中)分别计算这三组的CV值 lambda <- seq(0, 1, length.out=100) mse1 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda) mse2 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda) mse3 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda) # ④(岭回归中)分别画出这三组的两张图,两张图均以lambd为横坐标,一张图以CV error为纵坐标,一张图以Prediction error为纵坐标,两张图同分开在Plots位置 library(glmnet) par(mfrow=c(1,2)) # 画CV error图 plot(lambda, mse1, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta1") points(lambda, mse2, type="l", col="red") points(lambda, mse3, type="l", col="blue") # 画Prediction error图 fit1 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse1)]) fit2 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse2)]) fit3 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse3)]) y_pred1 <- predict(fit1, newx=X) y_pred2 <- predict(fit2, newx=X) y_pred3 <- predict(fit3, newx=X) pred_error1 <- mean((y - y_pred1)^2) pred_error2 <- mean((y - y_pred2)^2) pred_error3 <- mean((y - y_pred3)^2) plot(lambda, pred_error1, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta1") points(lambda, pred_error2, type="l", col="red") points(lambda, pred_error3, type="l", col="blue")。按以下要求修改R代码:将三组的分别以CV error和Prediction error为纵坐标的图,每次Plots位置只会出现同一个组的两张分别以CV error和Prediction error为纵坐标的图
可以按照以下步骤修改代码:
1. 将 par(mfrow=c(1,2)) 改为 par(mfrow=c(2,3)),表示将Plots位置改为6个。
2. 将 plot(lambda, mse1, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta1") 和 plot(lambda, pred_error1, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta1") 改为:
```
# 画Beta1的CV error图
plot(lambda, mse1, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta1 CV error")
# 画Beta1的Prediction error图
plot(lambda, pred_error1, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta1 Prediction error")
```
这样就能够将同一组的两张图排列在一起,并且更明确地表示出它们的含义。
3. 将上述代码中的“Beta1”改为“Beta2”和“Beta3”,分别表示三组系数的图像。修改后的完整代码如下:
```
# ①建立50×30的随机数据和30个变量
set.seed(123)
X <- matrix(rnorm(50*30), ncol=30)
y <- rnorm(50)
# ②生成三组不同系数的线性模型
beta1 <- rnorm(30, mean=1, sd=0.5)
beta2 <- rnorm(30, mean=2, sd=0.5)
beta3 <- rnorm(30, mean=3, sd=0.5)
# 定义一个函数用于计算线性回归的CV值
cv_linear <- function(X, y, k=10, lambda=NULL) {
n <- nrow(X)
if (is.null(lambda)) {
lambda <- seq(0, 1, length.out=100)
}
mse <- rep(0, length(lambda))
folds <- sample(rep(1:k, length.out=n))
for (i in 1:k) {
X_train <- X[folds!=i, ]
y_train <- y[folds!=i]
X_test <- X[folds==i, ]
y_test <- y[folds==i]
for (j in 1:length(lambda)) {
fit <- glmnet(X_train, y_train, alpha=0, lambda=lambda[j])
y_pred <- predict(fit, newx=X_test)
mse[j] <- mse[j] + mean((y_test - y_pred)^2)
}
}
mse <- mse / k
return(mse)
}
# ③(线性回归中)分别计算这三组的CV值
lambda <- seq(0, 1, length.out=100)
mse1 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda)
mse2 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda)
mse3 <- cv_linear(X, y, lambda=lambda)
# ④(岭回归中)分别画出这三组的两张图,每组两张图均以lambda为横坐标:
library(glmnet)
par(mfrow=c(2,3))
# 画Beta1的CV error图
plot(lambda, mse1, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta1 CV error")
# 画Beta1的Prediction error图
fit1 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse1)])
y_pred1 <- predict(fit1, newx=X)
pred_error1 <- mean((y - y_pred1)^2)
plot(lambda, pred_error1, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta1 Prediction error")
# 画Beta2的CV error图
plot(lambda, mse2, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta2 CV error")
# 画Beta2的Prediction error图
fit2 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse2)])
y_pred2 <- predict(fit2, newx=X)
pred_error2 <- mean((y - y_pred2)^2)
plot(lambda, pred_error2, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta2 Prediction error")
# 画Beta3的CV error图
plot(lambda, mse3, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Beta3 CV error")
# 画Beta3的Prediction error图
fit3 <- glmnet(X, y, alpha=0, lambda=lambda[which.min(mse3)])
y_pred3 <- predict(fit3, newx=X)
pred_error3 <- mean((y - y_pred3)^2)
plot(lambda, pred_error3, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Beta3 Prediction error")
```
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