nii图像冠状面和水平面互换的matlab代码

在MATLAB中，处理nii（NeuroImaging Informatics Technology Initiative）格式的图像数据，并互换其冠状面（coronal）和水平面（sagittal），可以使用一些专门的工具箱，如`nilearn`或`Brainstorm`. 这里提供一种基本的方法，假设你已经安装了`nii`读取库。

% 加载必要的库
if ~isToolboxInstalled('nifti')
    disp('You need the NIFTI toolbox installed.')
    return;
end

% 加载nii文件
filename = 'your_nii_file.nii.gz'; % 替换为你实际的nii文件路径
img = niregister(niiread(filename), 'T1w'); % 如果有偏移，先校准

% 获取原始图像的维度信息
dim = size(img.img);

% 冠状面到水平面的互换通常意味着沿着第2维（y轴）操作
switched_img = zeros(dim(1), dim(3), dim(4)); % 新的图像矩阵
switched_img(:, :, :) = img.img(:, fliplr(img.img(:, :, 2)), :); % 将y轴对称翻转

% 保存变换后的nii文件
new_filename = 'switched_' + filename; % 新的文件名
niiwrite(switched_img, new_filename);

注意，这个例子假设你的nii文件已经是标准的三维结构。如果需要进一步处理（例如，脑去除、空间标准化等），可能还需要额外步骤。