PET的mat文件格式转nii图像代码
时间: 2023-05-29 21:06:50 浏览: 384
LabelMe之json转nii
由于PET的mat文件格式与nii图像格式不同,因此需要进行转换。以下是将PET的mat文件格式转换为nii图像的Python代码:
```python
import numpy as np
import scipy.io as sio
import nibabel as nib
# 读取mat文件
mat = sio.loadmat('PET.mat')
data = mat['PET']
# 将数据翻转
data = np.flipud(data)
# 创建nii图像对象
img = nib.Nifti1Image(data, np.eye(4))
# 保存为nii文件
nib.save(img, 'PET.nii')
```
首先,使用`scipy.io`模块中的`loadmat()`函数读取PET.mat文件,得到数据数组。然后,由于PET的mat文件格式与nii图像格式的坐标系方向不同,需要将数据翻转。最后,使用`nibabel`模块中的`Nifti1Image()`函数创建nii图像对象,并使用`nib.save()`函数将其保存为nii文件。
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