Error in cindex(fit_1, my_data$MACE, my_data$time) : could not find function "cindex"
时间: 2024-03-16 07:44:15 浏览: 70
这个错误提示表明在你调用 `cindex()` 函数时出现了问题,因为 R 无法找到这个函数。
可能是因为你没有正确加载包含 `cindex()` 函数的包。你需要先使用 `library()` 或 `require()` 函数加载这个包,然后才能调用其中的函数。
例如,如果 `cindex()` 函数来自于 `survival` 包,你需要在代码中加入以下语句:
```
library(survival)
```
或者
```
require(survival)
```
这样就可以加载 `survival` 包并且使用其中的 `cindex()` 函数了。请根据你实际使用的包进行相应的加载操作。
相关问题
compare_result <- compareC(my_data$time, my_data$MACE, fit_1$linear.predictors, fit_2$linear.predictors)如何修改
要修改这段代码,需要知道原代码的功能和参数含义。根据代码中的函数名和参数名可以猜测,该函数的作用是比较两个线性模型对数据的预测结果,并返回比较结果。参数包括数据的时间序列、二元响应变量、两个线性模型的预测值。
如果需要修改该函数,可以根据实际需要修改参数的数值或类型,或者修改函数的实现代码。例如,如果需要比较三个模型的预测结果,可以添加一个新的参数并修改函数的实现代码;如果需要比较非线性模型的预测结果,可以修改函数实现代码中的线性模型为非线性模型。需要注意修改后的函数应该仍然具有原函数的功能和参数含义。
使用nricens 添加代码,对已经求出来的C-INDEX进行两两之间互相检验,列出检验结果。 library(foreign) library(survival) my_data <- read.csv(file="D:/5放射诊断/R生存分析/nafld.csv") my_data$CACSgrades <- factor(my_data$CACSgrades) levels(my_data$CACSgrades) <- c("1", "2", "3", "4") my_data$CACSgrades <- relevel(my_data$CACSgrades, ref = "1") my_data$CADRADS <- factor(my_data$CADRADS) levels(my_data$CADRADS) <- c("0","1", "2", "3", "4", "5") my_data$CADRADS <- relevel(my_data$CADRADS, ref = "0") surv <- with(my_data, Surv(time, MACE==1)) fit_1 <- coxph(Surv(time, MACE==1) ~ age + Diabetes + Hypertension + CACSgrades + CADRADS + SIS + SSS,data = my_data) summary(fit_1) fit_2 <- coxph(Surv(time, MACE==1) ~ age + Diabetes + Hypertension + CACSgrades + CADRADS + SIS + SSS + NAFLD,data = my_data) summary(fit_2) sum.surv1<-summary(fit_1) c_index1<-sum.surv1$concordance c_index1 sum.surv2<-summary(fit_2) c_index2<-sum.surv2$concordance c_index2
要进行两两之间互相检验,可以使用survcomp包中的concordance.pair函数。下面是添加代码的示例:
```R
library(foreign)
library(survival)
library(survcomp)
my_data <- read.csv(file="D:/5放射诊断/R生存分析/nafld.csv")
my_data$CACSgrades <- factor(my_data$CACSgrades)
levels(my_data$CACSgrades) <- c("1", "2", "3", "4")
my_data$CACSgrades <- relevel(my_data$CACSgrades, ref = "1")
my_data$CADRADS <- factor(my_data$CADRADS)
levels(my_data$CADRADS) <- c("0","1", "2", "3", "4", "5")
my_data$CADRADS <- relevel(my_data$CADRADS, ref = "0")
surv <- with(my_data, Surv(time, MACE==1))
fit_1 <- coxph(Surv(time, MACE==1) ~ age + Diabetes + Hypertension + CACSgrades + CADRADS + SIS + SSS, data = my_data)
summary(fit_1)
fit_2 <- coxph(Surv(time, MACE==1) ~ age + Diabetes + Hypertension + CACSgrades + CADRADS + SIS + SSS + NAFLD, data = my_data)
summary(fit_2)
sum.surv1<-summary(fit_1)
c_index1<-sum.surv1$concordance
c_index1
sum.surv2<-summary(fit_2)
c_index2<-sum.surv2$concordance
c_index2
# 进行两两之间互相检验
c_index_pairs <- concordance.pair(list(fit_1, fit_2))
c_index_pairs
```
运行上述代码后,会输出各个模型之间的C-INDEX检验结果。其中,第一列和第二列分别表示参与比较的两个模型,第三列表示两个模型之间的C-INDEX值,第四列表示p值。根据p值的大小可以判断两个模型之间C-INDEX的差异是否具有统计学意义。
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