不使用survcomp包,添加代码,对已经求出来的C-INDEX进行两两之间互相检验,列出检验结果。 #Cox回归案例1 library(foreign) library(survival) # 1. 导入数据集 my_data <- read.csv(file="D:/5放射诊断/R生存分析/nafld.csv") # 2. 转换分级变量 my_data$CACSgrades <- factor(my_data$CACSgrades) levels(my_data$CACSgrades) <- c("1", "2", "3", "4") my_data$CACSgrades <- relevel(my_data$CACSgrades, ref = "1") my_data$CADRADS <- factor(my_data$CADRADS) levels(my_data$CADRADS) <- c("0","1", "2", "3", "4", "5") my_data$CADRADS <- relevel(my_data$CADRADS, ref = "0") surv <- with(my_data, Surv(time, MACE==1)) #Cox回归模型拟合,多因素,CACSgrades fit_1 <- coxph(Surv(time, MACE==1) ~ age + Diabetes + Hypertension + CACSgrades + CADRADS + SIS + SSS, data = my_data) summary(fit_1) fit_2 <- coxph(Surv(time, MACE==1) ~ age + Diabetes + Hypertension + CACSgrades + CADRADS + SIS + SSS + NAFLD, data = my_data) summary(fit_2) sum.surv1<-summary(fit_1) c_index1<-sum.surv1$concordance c_index1 sum.surv2<-summary(fit_2) c_index2<-sum.surv2$concordance c_index2
时间: 2024-03-14 07:45:12 浏览: 95
如果你不想使用`survcomp`包,你可以使用以下代码来对已经求出的C-INDEX进行两两之间的互相检验,并将检验结果列出:
```
# 创建一个矩阵来存储C-INDEX差异
c_index_diff <- matrix(NA, nrow = 2, ncol = 2)
# 使用“coxph”函数计算两个模型之间的C-INDEX差异,并将结果存储在矩阵中
c_index_diff[1, 2] <- coxph.wtest(fit_1, fit_2)$p.value
# 输出检验结果
if (c_index_diff[1, 2] < 0.05) {
cat("The difference between Model 1 and Model 2 is significant (p =", c_index_diff[1, 2], ")\n")
} else {
cat("The difference between Model 1 and Model 2 is not significant (p =", c_index_diff[1, 2], ")\n")
}
```
这里,我们使用`coxph.wtest`函数计算两个模型之间的C-INDEX差异,并将结果存储在矩阵`c_index_diff`中。然后,我们输出检验结果,如果p值小于0.05,则判定差异显著,否则判定差异不显著。你可以根据需要扩展这个代码来计算更多模型之间的C-INDEX差异,以及输出更完整的检验结果。
相关问题
R语言COX回归中的C-INDEX如何进行两两之间的比较
在R语言中,我们可以使用`survcomp`包中的`pairwise_survdiff()`函数对两两之间的C-INDEX值进行比较。
首先,我们需要用`coxph()`函数拟合每个模型,并使用`survC1()`函数计算每个模型的C-INDEX值。
``` r
library(survcomp)
library(survival)
# 导入数据
data <- read.csv("D:/5放射诊断/R生存分析/nafld.csv")
# 将CACSgrades和CADRADS转换为因子型变量
data$CACSgrades <- as.factor(data$CACSgrades)
data$CADRADS <- as.factor(data$CADRADS)
# 拟合模型
model1 <- coxph(Surv(time, MACE) ~ sex + age + NAFLD + Hypertension + Diabetes + Dyslipidemia + smoking, data = data)
model2 <- coxph(Surv(time, MACE) ~ sex + age + NAFLD + Hypertension + Diabetes + Dyslipidemia + smoking + CACSgrades, data = data)
model3 <- coxph(Surv(time, MACE) ~ sex + age + NAFLD + Hypertension + Diabetes + Dyslipidemia + smoking + CACSgrades + CADRADS, data = data)
# 计算C-INDEX值
cindex1 <- survC1(model1, data, time = "time", event = "MACE")
cindex2 <- survC1(model2, data, time = "time", event = "MACE")
cindex3 <- survC1(model3, data, time = "time", event = "MACE")
```
接下来,我们可以使用`pairwise_survdiff()`函数对两两之间的C-INDEX值进行比较,以检查它们之间是否有显著差异。
``` r
# 对两两之间的C-INDEX值进行比较
pairwise_survdiff(list("Model 1 vs. Model 2" = cindex1$cindex, "Model 1 vs. Model 3" = cindex2$cindex, "Model 2 vs. Model 3" = cindex3$cindex))
```
这将输出一个表格,显示每对模型之间的p值和显著性水平。如果p值小于0.05,则意味着这两个模型的C-INDEX值之间有显著差异。
cox的C-index两两检验
C-index(concordance index)是一种用于评估预测模型预测准确性的指标,通常用于评估生存分析模型的预测能力。Cox模型是常用的生存分析模型之一,C-index在Cox模型中也可以使用。
如果你想对Cox模型的C-index进行两两检验,可以采用以下步骤:
1. 确定需要进行C-index检验的模型个数,假设有k个模型。
2. 对于每一对模型,将两个模型的预测结果进行比较,得到模型1的预测值和模型2的预测值。
3. 计算C-index得分,评估模型1和模型2的预测能力。C-index得分越高,说明模型的预测能力越好。
4. 将每一对模型的C-index得分记录下来,得到一个k x k的矩阵,称为C-index矩阵。
5. 对C-index矩阵进行统计分析,比如计算均值、方差、相关系数等,得到模型间的差异性。
需要注意的是,在进行C-index两两检验时,需要使用相同的数据集和相同的评估指标。同时,由于C-index得分受到样本大小、事件发生率、模型选择和变量选择等因素的影响,因此需要谨慎解释检验结果。
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