编写一个shell脚本，要求如下：1.批量提取fasta文件每行中每个‘>’和对应每行第1个‘’之间的英文单词作为第一列，将对应每行第1个‘_’和每行第2个‘_’之间的字符串作为第二列。2.循环文件夹每个fasta文件。3.最终将每个fasta的循环结果输出合并为txt文本格式。

以下是一个可能的解决方案：

#!/bin/bash

# 检查是否指定了输入文件夹
if [ $# -ne 1 ]; then
  echo "Usage: $0 input_folder"
  exit 1
fi

# 输出文件名
output_file="output.txt"

# 删除旧的输出文件，如果存在的话
if [ -f "$output_file" ]; then
  rm "$output_file"
fi

# 循环处理每个fasta文件
for fasta_file in "$1"/*.fasta; do
  # 提取文件名作为第一列
  filename=$(basename "$fasta_file" .fasta)
  
  # 提取每行的信息，输出到临时文件
  grep "^>" "$fasta_file" | while read line; do
    # 提取第二列
    second_col=$(echo "$line" | cut -d "_" -f 2)
    
    # 提取第一列
    first_col=$(echo "$line" | sed -e 's/^>//g' -e 's/\s.*//g')
    
    # 输出到临时文件
    echo "$first_col	$second_col" >> "$output_file.tmp"
  done
done

# 合并临时文件到输出文件
cat "$output_file.tmp" >> "$output_file"

# 删除临时文件
rm "$output_file.tmp"

这个脚本接受一个参数，即输入文件夹的路径。它会循环处理输入文件夹中的每个fasta文件，并将结果输出到一个txt文件中。每个行的第一列是fasta文件名，第二列是对应行中提取的字符串。输出文件的名称可以通过修改变量`output_file`来指定。