edge_index什么意思

时间: 2024-01-14 07:03:42 浏览: 29
在图论中,edge_index通常表示一个图的边集,它是一个2行的矩阵,每一列表示一条边,其中第一行表示边的起点,第二行表示边的终点。例如,对于一个无向图,如果有三条边(0,1)、(1,2)和(2,0),那么edge_index可以表示为: ``` edge_index = [[0, 1, 2, 1], [1, 0, 1, 2]] ``` 这个矩阵告诉我们,第一条边连接的是节点0和节点1,第二条边连接的是节点1和节点2,第三条边连接的是节点2和节点0。 在图神经网络中,edge_index通常作为输入数据的一部分,用于表示输入图的拓扑结构,以便在GCN、GAT等模型中进行消息传递和特征聚合。
相关问题

x, edge_index = data.x, data.edge_index中的 edge_index 是什么意思

### 回答1: Edge_index 是图数据结构中用来存储边信息的数组,它有两行数据,第一行是所有边的起点,第二行是它们对应的终点。换句话说,edge_index 的第 i 个元素表示了一条边,它连接了两个点 x[edge_index[0][i]] 和 x[edge_index[1][i]]。 ### 回答2: 在PyTorch Geometric中,data.edge_index是Graph数据中存储边信息的关键变量。它是一个2行的矩阵,表示图中每条边的起始节点和结束节点的索引。 具体来说,edge_index的第一行包含所有边的起始节点索引,第二行包含所有边的结束节点索引。这样的表示方式可以有效地存储大型图中的边信息,同时也方便了边的处理和操作。 通过将edge_index与其他属性(如data.x)结合使用,我们可以对图数据进行节点特征和边信息之间的联结和计算。例如,可以通过索引data.x来获取每个节点的特征,并使用edge_index来访问和处理节点之间的边。 总之,edge_index的作用是表示图数据中每条边的起始节点和结束节点的索引,方便对边信息进行处理和计算。 ### 回答3: edge_index 是表示图中边的索引的一维张量。在使用图神经网络进行图数据的处理时,我们需要将图的节点和边的信息转换为张量进行计算。其中,x 是表示图中节点特征的张量,edge_index 是表示图中边的连接关系的张量。 edge_index 的形状为 (2, num_edges),其中 num_edges 是图中边的数量。具体来说,edge_index[0] 表示边的起始节点的索引,edge_index[1] 表示边的终止节点的索引。例如,若 edge_index[0][i] = a,edge_index[1][i] = b,则表示图中存在一条从节点 a 到节点 b 的边。 通过 edge_index,我们可以方便地获取图中任意两个节点之间的连接关系。同时,由于采用了一维张量的形式表示边的索引,可以提高计算效率和节省内存空间。 在使用 edge_index 进行图神经网络的计算时,我们可以根据节点特征 x 和边的索引信息进行各种图算法和图神经网络算法,例如图卷积网络(Graph Convolutional Network, GCN)、GraphSage、GAT 等。

x, edge_index = data.x, data.edge_index中的data.edge_index是什么意思

data.edge_index是PyTorch Geometric中图数据的一部分,表示图中边的索引。edge_index由两个行向量组成,第一个行向量表示边的起点,第二个行向量表示边的终点。比如,如果data.edge_index第一个行向量的第i个元素是j,第二个行向量的第i个元素是k,那么就表示图中有一条连接节点j和k的边。

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def forward(self, data, org_edge_index): x = data.clone().detach() edge_index_sets = self.edge_index_sets device = data.device batch_num, node_num, all_feature = x.shape x = x.view(-1, all_feature).contiguous() gcn_outs = [] for i, edge_index in enumerate(edge_index_sets): edge_num = edge_index.shape[1] cache_edge_index = self.cache_edge_index_sets[i] if cache_edge_index is None or cache_edge_index.shape[1] != edge_num*batch_num: self.cache_edge_index_sets[i] = get_batch_edge_index(edge_index, batch_num, node_num).to(device) batch_edge_index = self.cache_edge_index_sets[i] all_embeddings = self.embedding(torch.arange(node_num).to(device)) weights_arr = all_embeddings.detach().clone() all_embeddings = all_embeddings.repeat(batch_num, 1) weights = weights_arr.view(node_num, -1) cos_ji_mat = torch.matmul(weights, weights.T) normed_mat = torch.matmul(weights.norm(dim=-1).view(-1,1), weights.norm(dim=-1).view(1,-1)) cos_ji_mat = cos_ji_mat / normed_mat dim = weights.shape[-1] topk_num = self.topk topk_indices_ji = torch.topk(cos_ji_mat, topk_num, dim=-1)[1] self.learned_graph = topk_indices_ji gated_i = torch.arange(0, node_num).T.unsqueeze(1).repeat(1, topk_num).flatten().to(device).unsqueeze(0) gated_j = topk_indices_ji.flatten().unsqueeze(0) gated_edge_index = torch.cat((gated_j, gated_i), dim=0) batch_gated_edge_index = get_batch_edge_index(gated_edge_index, batch_num, node_num).to(device) gcn_out = self.gnn_layers[i](x, batch_gated_edge_index, node_num=node_num*batch_num, embedding=all_embeddings) gcn_outs.append(gcn_out) x = torch.cat(gcn_outs, dim=1) x = x.view(batch_num, node_num, -1) indexes = torch.arange(0,node_num).to(device) out = torch.mul(x, self.embedding(indexes)) out = out.permute(0,2,1) out = F.relu(self.bn_outlayer_in(out)) out = out.permute(0,2,1) out = self.dp(out) out = self.out_layer(out) out = out.view(-1, node_num) return out

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