[coefficients, levels] = wavedec(unit_vec, wlev, lod,hid);
时间: 2023-10-16 21:02:52 浏览: 178
wavedec()函数是MATLAB中的小波变换函数,用于对输入的向量进行小波变换。
输入参数:
- unit_vec:输入的向量,即待进行小波变换的信号。
- wlev:小波变换的层数。通过控制层数可以控制小波变换的分辨率,层数越多,分解的尺度越细。
- lod和hid:小波变换的滤波器系数。lod是低频部分(近似分量)的滤波器系数,hid是高频部分(细节系数)的滤波器系数。
输出参数:
- coefficients:变换后得到的小波系数。它是一个向量,包括了所有的近似分量和各层的细节系数。
- levels:小波变换的层数。由于可能存在填充操作,实际得到的层数可能小于输入的层数wlev。
总结来说,wavedec()函数通过对输入信号进行小波变换,得到了各个层次的近似分量和细节系数。小波变换可以用于信号的分析、压缩等任务。
相关问题
import pandas as pd import numpy as np from sklearn.linear_model import LassoCV data = pd.read_excel('C:\\Users\\86183\\Desktop\\rat_eye.xlsx',header=None,index_col=0) # 提取'1389163_at'这一行的数据 gene = '1389163_at' gene_data = data.loc[gene] # 计算与其他行的相关系数 corr = data.corrwith(gene_data,axis=1) # 找到与指定基因相关系数最大的几行 top_k = 100 similar_rows = corr.abs().sort_values(ascending=False)[1:top_k+1].index print('与{}最相近的{}个基因分别是:'.format(gene, top_k)) for gene_name in similar_rows: print(gene_name) X = data.loc[similar_rows].T.values y = gene_data.values # 使用LassoCV进行交叉验证,选择最优的alpha值 model = LassoCV(cv=10, max_iter=10000, alphas=np.logspace(-4, 0, 100)) model.fit(X, y) # 打印模型系数,选择重要性较高的自变量 coefficients = model.coef_ important_indices = np.argsort(np.abs(coefficients))[::-1][:10] important_genes = [similar_rows[i] for i in important_indices] print('选择的重要自变量有:', important_genes)帮我改进一下这个代码,还有这个选择多少个自变量只能自己决定吗?不是模型决定多少变量吗
以下是改进后的代码,并回答您的问题:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn.linear_model import LassoCV
# 读入数据
data = pd.read_excel('C:\\Users\\86183\\Desktop\\rat_eye.xlsx', header=None, index_col=0)
# 提取指定基因的行数据
gene = '1389163_at'
gene_data = data.loc[gene]
# 计算与其他行的相关系数
corr = data.corrwith(gene_data, axis=1)
# 找到与指定基因相关系数最大的几行
top_k = 100
similar_rows = corr.abs().sort_values(ascending=False)[1:top_k+1].index
print('与{}最相近的{}个基因分别是:'.format(gene, top_k))
for gene_name in similar_rows:
print(gene_name)
# 使用LassoCV进行交叉验证,选择最优的alpha值
model = LassoCV(cv=10, max_iter=10000, alphas=np.logspace(-4, 0, 100))
X = data.loc[similar_rows].T.values
y = gene_data.values
model.fit(X, y)
# 打印模型系数,选择重要性较高的自变量
coefficients = model.coef_
important_indices = np.argsort(np.abs(coefficients))[::-1]
important_genes = [similar_rows[i] for i in important_indices]
# 根据模型系数的大小,选择重要性较高的前k个自变量
k = 10
important_genes = important_genes[:k]
print('选择的重要自变量有:', important_genes)
```
改进内容:
1. 添加注释,使代码更易读;
2. 将代码分块,使逻辑更清晰;
3. 将选择重要自变量的部分,改为根据模型系数的大小选择重要性较高的前k个自变量;
4. 将选择重要自变量的个数k设置为可调参数。
关于选择自变量的个数,实际上可以通过交叉验证的方式来选择,这也是LassoCV所做的。但是,在这个代码中,我们只是选择了重要性较高的前k个自变量。如果您想要自动选择自变量的个数,可以使用交叉验证的方式来实现。
function [C,raw_mom]=aPCE_coef(po,x) % input % po: polynomial order % x: data (1 column) % % output % C: coefficients of a polynomial (highest to lowest) % raw_mom: raw momoments used for getting C % k-th raw moments krm = zeros(1,2*po); for rm = 0:2*po-1 krm(rm+1) = mean( x.^rm ); end % form matrices to get the coefficients A = zeros(po+1,po+1); for br = 1:po A(br,:) = krm(br:br+po); end A(end,end) = 1; B = zeros(po+1,1); B(end) = 1; % determine coefficients C = flipud(A^(-1)*B); % output option if nargout == 2 raw_mom = krm; end
这段代码是用于计算多项式混沌展开(aPCE)的系数和原始矩的函数。下面是代码的主要步骤解释:
1. 计算输入数据 x 的 k 阶原始矩,其中 k 的范围为 0 到 2*po-1。
2. 构建用于求解系数的矩阵 A 和向量 B。矩阵 A 的每一行都是 k 阶原始矩的一部分,矩阵 B 是一个全零向量,只有最后一个元素为 1。
3. 使用矩阵 A 和向量 B,通过求解线性方程组得到多项式的系数 C。注意,这里使用了矩阵的逆来求解。
4. 如果输出选项为 2,那么同时返回原始矩 raw_mom。
希望对你有所帮助!如果还有其他问题,请随时提问。
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