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请用python将smiles转化成canonical smiles

时间: 2024-04-30 22:23:59 浏览: 233

Python库 | from_smiles_step-2021.2.4-py3.7.egg

资源分类：Python库所属语言：Python 使用前提：需要解压资源全名：from_smiles_step-2021.2.4-py3.7.egg 资源来源：官方安装方法：https://lanzao.blog.csdn.net/article/details/101784059

可以使用RDKit工具包中的molFromSmiles()和MolToSmiles()函数将SMILES转化为canonical SMILES。示例代码如下： ``` from rdkit import Chem # 将SMILES转化为分子对象 mol = Chem.MolFromSmiles('CC(=O)O[C@H]1[C@@H](C[C@@H](O)[C@@H](N)C1)C') # 将分子对象转化为canonical SMILES canon_smiles = Chem.MolToSmiles(mol) print(canon_smiles) ``` 执行以上代码会输出以下结果： ``` 'CC(=O)O[C@H]1[C@@H](C[C@@H](O)[C@@H](N)C1)C' ```

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