化合物逆合成分析的python完整代码。

当然，我可以为您提供一个简单的示例代码来进行化合物逆合成分析。请注意，这只是一个基本的示例，实际的逆合成分析可能需要更复杂的算法和数据。

以下是一个使用Python的简单化合物逆合成分析的示例代码：

# 导入所需的库
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import AllChem
from rdkit.Chem import rdFMCS
from rdkit.Chem import Draw

# 定义目标化合物的SMILES字符串
target_smiles = 'CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O'

# 定义反应物列表
reactants = [
    'CC(=O)O',
    'C1=CC=CC=C1',
    'O=C'
]

# 将SMILES字符串转换为RDKit的分子对象
target_mol = Chem.MolFromSmiles(target_smiles)

# 定义逆合成函数
def retrosynthetic_analysis(target, reactant_list):
    # 创建反应物分子对象列表
    reactants_mols = [Chem.MolFromSmiles(reactant) for reactant in reactant_list]

    # 执行逆合成分析
    mcs = rdFMCS.FindMCS([target] + reactants_mols)
    mcs_smarts = mcs.smartsString

    # 输出逆合成结果
    print('逆合成SMARTS：', mcs_smarts)

    # 将逆合成结果转换为RDKit的反应对象
    rxn = AllChem.ReactionFromSmarts(mcs_smarts)

    # 对逆合成结果进行反应
    products = [rxn.RunReactants([target_mol] + reactants_mols)[0] for reactant in reactants_mols]

    # 绘制反应产物
    for idx, product in enumerate(products):
        product_smiles = Chem.MolToSmiles(product[0])
        print('产物', idx+1, '：', product_smiles)
        Draw.MolToFile(product[0], f'product_{idx+1}.png')

# 调用逆合成函数
retrosynthetic_analysis(target_mol, reactants)

请注意，这只是一个简单的示例代码，用于演示化合物逆合成分析的基本概念。实际应用中，可能需要更复杂和完善的算法和数据来进行逆合成分析。

这段代码使用RDKit库来处理化学信息，并使用MCSS算法进行逆合成分析。它将目标化合物的SMILES字符串转换为RDKit的分子对象，定义了反应物列表，并执行逆合成分析来获取逆合成SMARTS。然后，它将SMARTS转换为RDKit的反应对象，并使用目标化合物和反应物进行反应，得到反应产物。最后，它绘制并保存每个产物的结构图像。

请确保在运行代码之前安装了RDKit库，并根据需要调整代码以满足您的具体需求。