from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage from matplotlib import pyplot as plt X = [[i] for i in [2, 8, 0, 4, 1, 9, 9, 0]] Z = linkage(X, 'average') fig = plt.figure(figsize=(6,3)) # 控制图的大小 dn = dendrogram(Z) plt.rcParams["font.sans-serif"]=["SimHei"] plt.title('实验一') plt.xlabel('聚类谱系图') plt.ylabel('聚类水平') plt.show()
时间: 2024-04-02 20:37:04 浏览: 88
这段代码使用了Python的SciPy库来进行层次聚类,并使用matplotlib库进行可视化。具体来说,代码的功能如下:
1. 定义一个长度为8的一维数组X,数组中的元素分别为2, 8, 0, 4, 1, 9, 9, 0。
2. 调用linkage()函数进行层次聚类,其中'average'表示使用平均链接合并策略。聚类得到的结果保存在变量Z中。
3. 创建一个大小为(6,3)的图形对象fig。
4. 对聚类树进行可视化,使用dendrogram()函数绘制聚类树,并将聚类树绘制在变量dn中。
5. 设置字体为中文显示,设置图像标题为'实验一',x轴标签为'聚类谱系图',y轴标签为'聚类水平'。
6. 显示图像。
总的来说,这段代码实现了对一维数据进行层次聚类,并将聚类结果以树状图的形式可视化。可以根据需要修改代码中的数据、聚类合并策略和图像参数等。
相关问题
import numpy as np from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage import matplotlib.pyplot as plt # 生成一个距离矩阵 X = np.array([[0, 1], [0.4, 1], [0.7, 3], [1, 1], [1.5, 2]]) # 使用Ward方法进行层次聚类 Z = linkage(X, 'ward') # 绘制树状图 fig = plt.figure(figsize=(5, 3)) dn = dendrogram(Z) plt.show()这段代码中的ward方法是什么
在这段代码中,`ward` 是 `scipy.cluster.hierarchy.linkage` 函数的一个参数,它代表层次聚类算法的链接方法之一。Ward方法是一种凝聚式聚类算法,它的特点是将两个群集合并时,合并后的群集的平方误差和最小。在实际应用中,Ward方法常用于处理凸形的数据集,它能够较好地保持群集的凸性。
帮我解释以下代码:from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram from matplotlib import pyplot as plt import numpy as np X = [[i] for i in [2, 8, 0, 4, 1, 9, 9, 0]] def plot_dendrogram(model, **kwargs): counts = np.zeros(model.children_.shape[0]) n_samples = len(model.labels_) for i, merge in enumerate(model.children_): current_count = 0 for child_idx in merge: if child_idx < n_samples: current_count += 1 else: current_count += counts[child_idx - n_samples] counts[i] = current_count linkage_matrix = np.column_stack( [model.children_, model.distances_, counts] ).astype(float) dendrogram(linkage_matrix, **kwargs) model = AgglomerativeClustering(n_clusters=None, distance_threshold=0, linkage='average') model.fit(X) plot_dendrogram(model) plt.show()
这段代码演示了如何使用层次聚类算法对数据进行聚类,并使用树状图展示聚类结果。
具体来说,代码中首先导入了需要用到的库,包括了sklearn的AgglomerativeClustering,scipy的dendrogram和matplotlib的pyplot。然后定义了一个列表X,其中包含了8个数字。接下来定义了一个函数plot_dendrogram,用于绘制树状图。在函数中,首先计算了每个聚类簇的样本数,然后构造了一个连接矩阵,将每个聚类簇的父子关系、距离以及样本数放在一起。最后调用dendrogram函数,传入连接矩阵和其他参数,即可绘制树状图。
接着,通过使用AgglomerativeClustering算法,将X数据集进行聚类。其中n_clusters=None表示不指定聚类的个数,distance_threshold=0表示聚类时不考虑距离阈值,linkage='average'表示使用平均链接法进行聚类。
最后,调用plot_dendrogram函数,传入已经训练好的聚类模型,即可绘制树状图展示聚类结果。最后调用plt.show()将图像显示出来。
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