如何保存scipy.cluster.hierarchy.dendrogram函数生成的树状图的参数
时间: 2023-09-08 19:04:53 浏览: 182
Heatmap_Dendrogram_Python:国家/地区数据的热图和树状图
### 回答1:
可以使用 matplotlib 模块的 savefig 函数将树状图保存为图片文件,或者使用 scipy.cluster.hierarchy.dendrogram 函数的参数 leaf_label_func 将树状图的参数保存到一个列表中。
### 回答2:
scipy.cluster.hierarchy.dendrogram函数生成树状图的参数包括层次聚类的结果、树的结构、颜色等信息。要保存这些参数,可以将它们保存为字典或文件。
一种方法是将参数保存为字典,然后将字典保存为文件。可以使用Python的pickle模块将字典保存为二进制文件,或使用json模块将字典保存为文本文件。
示例代码如下:
```python
import json
import pickle
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram
# 第一步,生成树状图的参数
# ...
# 将参数保存为字典
params = {
'clusters': dendrogram_obj['color_list'],
'tree_structure': dendrogram_obj['dcoord'],
# 其他参数...
}
# 第二步,将参数保存为文件
# Pickle模块保存为二进制文件
with open('dendrogram_params.pkl', 'wb') as f:
pickle.dump(params, f)
# Json模块保存为文本文件
with open('dendrogram_params.json', 'w') as f:
json.dump(params, f)
```
另一种方法是直接将生成的树状图保存为图片文件。可以使用Python的matplotlib库中的savefig函数将树状图保存为图片格式,如PNG、JPEG等。
示例代码如下:
```python
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram
# 第一步,生成树状图的参数
# ...
# 第二步,绘制树状图
fig = plt.figure(figsize=(10, 5))
dendrogram(dendrogram_obj)
plt.title('Dendrogram')
plt.xlabel('Samples')
plt.ylabel('Distance')
# 第三步,保存树状图为图片文件
plt.savefig('dendrogram.png')
```
以上是保存scipy.cluster.hierarchy.dendrogram函数生成的树状图的参数的两种方法。可根据需求选择适合的保存形式。
### 回答3:
要保存scipy.cluster.hierarchy.dendrogram函数生成的树状图的参数,首先需要理解dendrogram函数的输出。该函数会返回一个字典,其中包含一些关键信息。
要保存树状图的参数,可以按照以下步骤进行操作:
1. 导入必要的库和模块:
```python
import scipy.cluster.hierarchy as sch
import matplotlib.pyplot as plt
```
2. 使用dendrogram函数生成树状图:
```python
linkage_matrix = sch.linkage(data, method='complete') # 计算层次聚类所需的链接矩阵
dendrogram = sch.dendrogram(linkage_matrix) # 生成树状图并返回相关信息
```
3. 将树状图的参数保存到变量中:
```python
dist = dendrogram['dcoord'] # 保存垂直距离(dendrogram['dcoord'])
link = dendrogram['icoord'] # 保存连线坐标(dendrogram['icoord'])
```
4. 可选:绘制树状图并保存为图片:
```python
plt.figure(figsize=(10, 5))
plt.title('Dendrogram')
plt.xlabel('Samples')
plt.ylabel('Distance')
plt.plot(link, dist)
plt.savefig('dendrogram.png') # 将树状图保存为图片
```
通过以上步骤,我们可以将树状图的参数保存到变量中,从而实现对其后续处理或分析。另外,我们还可以选择将树状图保存为图片,以备后续查看或分享。
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