对p值进行fdr校正计算步骤
时间: 2024-01-29 07:03:48 浏览: 439
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进行FDR(False Discovery Rate)校正是为了控制多重假设检验中的错误发现率。以下是一种常用的FDR校正方法,称为Benjamini-Hochberg方法:
1. 收集所有需要进行FDR校正的原始p值。
2. 对这些原始p值进行升序排序,得到排序后的p值列表。
3. 对于每个排序后的p值(设为Pi),计算调整后的阈值(设为qi):
- 首先,计算调整因子m,其中m为排序后的p值总数。
- 然后,对于第i个排序后的p值(Pi),计算qi = (Pi * m) / i。
4. 对于每个排序后的p值(Pi),比较其与对应的qi:
- 如果Pi小于等于qi,则将该p值视为显著。
- 如果Pi大于qi,则将该p值视为不显著。
5. 使用以上步骤确定显著性水平,并进一步分析或报告显著结果。
需要注意的是,以上步骤仅适用于独立和相互独立的假设检验。如果你的假设检验之间存在依赖关系,例如多组对比或重复测量设计,你可能需要考虑其他FDR校正方法,如Benjamini-Yekutieli方法。
通过按照上述步骤对p值进行FDR校正,你可以控制多重假设检验中的错误发现率,并获得更可靠的显著性结果。
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