import wfdb import numpy as np import os import cv2 from PIL import Image import matplotlib.pyplot as plt # 设置数据集路径 data_path = 'mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0/' # 设置输出路径 output_path = 'ImageMITBIH/' N_beats_pos = [] A_beats_pos = [] V_beats_pos = [] F_beats_pos = [] L_beats_pos = [] R_beats_pos = [] qita_beats_pos = [] # 读取数据集中所有记录的文件名 records = wfdb.get_record_list('mitdb') print('file list =', records) # 循环遍历每个记录文件 for record in records: print('\n') print('Processing record:', record) # 读取记录文件中的信号和标注信息 all_signals, fields = wfdb.rdsamp(os.path.join(data_path, record)) signals = [x[0] for x in all_signals] annotations = wfdb.rdann(os.path.join(data_path, record), 'atr') print('signals =', signals) print('signals_amount =', len(signals)) print('fields =', fields) print('annotations =', annotations) # 获取每个心拍的位置和类别 beats_pos = annotations.sample beats_labels = annotations.symbol print('beats_pos =', beats_pos) print('pos_amount =', len(beats_pos)) print('beats_labels =', beats_labels) print('labels_amount =', len(beats_labels)) print('labels_forms =', list(set(beats_labels))) for i in range(len(beats_labels)): if beats_labels[i] == 'N': # 正常心拍 N_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'A': # 房性早搏 A_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'V': # 室性早搏 V_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'F': # 室性融合波 F_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'L': # 左束传导受阻 L_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'R': # 右束传导受阻 R_beats_pos.append(beats_pos[i]) else: # 其他异常心拍或无效信号 qita_beats_pos.append(beats_pos[i])逐句翻译一下
时间: 2023-12-30 12:05:49 浏览: 26
这是一个 Python 代码,用于处理心电图数据集。代码分为三个部分:
第一部分,设置数据集路径和输出路径,导入所需的库。
第二部分,循环遍历每个记录文件,读取信号和标注信息,获取每个心拍的位置和类别,并将其分别存储在对应的列表中。
第三部分,将不同类别的心拍位置存储在不同的列表中,最后保存到输出路径下。
具体解释如下:
- 导入 wfdb、numpy、os、cv2 和 PIL 库,以及 matplotlib.pyplot 库中的 plt 模块。
- 设置数据集路径为 'mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0/',输出路径为 'ImageMITBIH/'。
- 使用 wfdb 库中的 get_record_list() 函数获取数据集中所有记录的文件名列表。
- 循环遍历每个记录文件名,使用 wfdb 库中的 rdsamp() 函数读取信号和字段信息,使用 rdann() 函数读取标注信息。
- 获取每个心拍的位置和类别,分别存储在 beats_pos 和 beats_labels 列表中。
- 根据心拍类别将心拍位置存储在对应的列表中。
- 最后将不同类别的心拍位置列表保存到输出路径下的相应文件中。
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import wfdb import numpy as np import os import cv2 from PIL import Image import matplotlib.pyplot as plt # 设置数据集路径 data_path = 'mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0/' # 设置输出路径 output_path = 'ImageMITBIH/' N_beats_pos = [] A_beats_pos = [] V_beats_pos = [] F_beats_pos = [] L_beats_pos = [] R_beats_pos = [] qita_beats_pos = [] # 读取数据集中所有记录的文件名 records = wfdb.get_record_list('mitdb') print('file list =', records) # 循环遍历每个记录文件 for record in records: print('\n') print('Processing record:', record) # 读取记录文件中的信号和标注信息 all_signals, fields = wfdb.rdsamp(os.path.join(data_path, record)) signals = [x[0] for x in all_signals] annotations = wfdb.rdann(os.path.join(data_path, record), 'atr') print('signals =', signals) print('signals_amount =', len(signals)) print('fields =', fields) print('annotations =', annotations) # 获取每个心拍的位置和类别 beats_pos = annotations.sample beats_labels = annotations.symbol print('beats_pos =', beats_pos) print('pos_amount =', len(beats_pos)) print('beats_labels =', beats_labels) print('labels_amount =', len(beats_labels)) print('labels_forms =', list(set(beats_labels))) for i in range(len(beats_labels)): if beats_labels[i] == 'N': # 正常心拍 N_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'A': # 房性早搏 A_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'V': # 室性早搏 V_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'F': # 室性融合波 F_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'L': # 左束传导受阻 L_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'R': # 右束传导受阻 R_beats_pos.append(beats_pos[i]) else: # 其他异常心拍或无效信号 qita_beats_pos.append(beats_pos[i])解释每一句的意思
这是一段 Python 代码,用于处理心电图数据集。下面是对代码中每一句的解释:
1. `import wfdb import numpy as np import os import cv2 from PIL import Image import matplotlib.pyplot as plt`:导入需要用到的 Python 库。
2. `data_path = 'mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0/'`:设置数据集路径。
3. `output_path = 'ImageMITBIH/'`:设置输出路径。
4. `N_beats_pos = [] A_beats_pos = [] V_beats_pos = [] F_beats_pos = [] L_beats_pos = [] R_beats_pos = [] qita_beats_pos = []`:定义保存不同类别心拍位置的列表。
5. `records = wfdb.get_record_list('mitdb')`:获取数据集中所有记录的文件名。
6. `all_signals, fields = wfdb.rdsamp(os.path.join(data_path, record))`:读取记录文件中的信号和标注信息。
7. `signals = [x[0] for x in all_signals]`:将所有信号提取出来并保存在一个列表中。
8. `annotations = wfdb.rdann(os.path.join(data_path, record), 'atr')`:读取记录文件中的标注信息。
9. `beats_pos = annotations.sample`:获取每个心拍在信号中的位置。
10. `beats_labels = annotations.symbol`:获取每个心拍的类别。
11. `for i in range(len(beats_labels)): if beats_labels[i] == 'N': N_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'A': A_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'V': V_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'F': F_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'L': L_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'R': R_beats_pos.append(beats_pos[i]) else: qita_beats_pos.append(beats_pos[i])`:按照心拍类别将它们的位置保存在对应的列表中。
代码的目的是将心电图数据集中的心拍类别和位置提取出来,并根据不同类别保存在不同的列表中,以便进行后续处理。
import wfdb import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from scipy import signal # 读取心电数据 record = wfdb.rdrecord('D:/下载/ptb-xl-a-large-publicly-available-electrocardiography-dataset-1.0.3/records100/00000/00003_lr') # 获取心电信号 ecg_signal = record.p_signal[:, 0] # 获取采样频率 fs = record.fs # 获取时间轴 t = np.arange(ecg_signal.size) / fs # 去除基线漂移 ecg_detrend = signal.detrend(ecg_signal) # 定义滤波器 b, a = signal.butter(4, 0.2, 'low') # 进行滤波 ecg_filt = signal.filtfilt(b, a, ecg_detrend)请问用的是什么滤波方法
这段代码使用的是双向无延迟滤波器(即 `filtfilt` 函数),对信号进行了低通滤波,截止频率为 0.2 * fs,滤波器阶数为 4。由于 `filtfilt` 函数是双向滤波,因此可以消除滤波器引入的相位延迟,保持信号的相位不变。这种滤波方法可以更好地保留信号的高频成分和细节信息,同时去除低频噪声和基线漂移。