mafft-7.525-without-extensions-src解压这个压缩包
时间: 2024-10-12 18:17:45 浏览: 8
`mafft-7.525-without-extensions-src.tgz`是一个使用`.tgz`格式的归档文件,它包含了MAFFT (Multiple Alignment Finder using Fast Fourier Transform)版本7.525的一个源代码版本,但去除了扩展模块。要解压这个文件,你需要使用`tar`工具。在终端中输入以下命令:
```bash
tar -C /mnt/e/fcc -xzvf mafft-7.525-without-extensions-src.tgz
```
这里解释一下各个部分:
- `-C /mnt/e/fcc`: 指定解压的目标目录,这里是`/mnt/e/fcc`。
- `-x`: 表示提取(extract)。
- `-z`: 如果你的系统支持gzip压缩,这表示解压缩gzip文件,如果支持xz压缩,则不需要这个选项。
- `-v`: 显示详细操作步骤。
- `vf`: `f`指定了要解压的文件名字,即`mafft-7.525-without-extensions-src.tgz`。
执行此命令后,原始的压缩文件会被解压,并在`/mnt/e/fcc`目录下生成名为`mafft-7.525-without-extensions-src`的文件夹,里面包含解压后的源代码和其他相关文件。
相关问题
mafft --localpair
mafft --localpair是MAFFT软件中的一个选项,用于进行局部比对。它适用于序列较短且数量较少的情况。具体用法是在命令行中输入"mafft --localpair input_file > output_file",其中input_file是输入文件的路径,output_file是输出文件的路径。这个选项会使用迭代优化的方法进行局部比对,以提高比对的准确性。\[2\]
#### 引用[.reference_title]
- *1* [使用mafft进行多序列比对](https://blog.csdn.net/weixin_43569478/article/details/108079207)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insert_down28v1,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
- *2* [核苷酸pi值计算方法](https://blog.csdn.net/weifanbio/article/details/123222119)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insert_down28v1,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
- *3* [生信步骤|MAFFT结合HMMER进行多序列比对和基于隐马模型的基因搜索](https://blog.csdn.net/m0_64240043/article/details/127934553)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insert_down28v1,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
[ .reference_list ]
If unsure which option to use, try 'mafft --auto input > output'. For more information, see 'mafft --help', 'mafft --man' and the mafft page. The default gap scoring scheme has been changed in version 7.110 (2013 Oct). It tends to insert more gaps into gap-rich regions than previous versions. To disable this change, add the --leavegappyregion option.
如果不确定使用哪个选项,请尝试使用“mafft --auto input > output”。更多信息,请参见“mafft --help”,“mafft --man”以及mafft页面。在版本7.110(2013年10月)中, 默认的间隙评分方案已更改。它倾向于在间隙丰富的区域插入更多的间隙比以前的版本。如果要禁用此更改,请添加--leavegappyregion选项。