这段程序import os dir_path = "C:/Users/1028/Desktop/r" cancer='HNSC'#设置变量 data_dir = os.path.join(dir_path, "tcga_data", cancer) train_path = os.path.join(data_dir, "ml_input.csv") label_path = os.path.join(data_dir, "tab_label.csv") train = np.genfromtxt(train_path, delimiter=',', skip_header=1) target = pd.read_csv(label_path, index_col=0).values.ravel() indices = train[:, 2:].T train = train[:, 2:].T的这个错误C:\Users\1028\Desktop\python\python.exe C:\Users\1028\Desktop\r_Python\Python\main.py Traceback (most recent call last): File "C:\Users\1028\Desktop\r_Python\Python\main.py", line 105, in <module> train = np.genfromtxt(train_path, delimiter=',', skip_header=1) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\numpy\lib\npyio.py", line 1980, in genfromtxt fid = np.lib._datasource.open(fname, 'rt', encoding=encoding) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\numpy\lib\_datasource.py", line 193, in open return ds.open(path, mode, encoding=encoding, newline=newline) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\numpy\lib\_datasource.py", line 533, in open raise FileNotFoundError(f"{path} not found.") FileNotFoundError: C:/Users/1028/Desktop/r\tcga_data\HNSC\ml_input.csv not found. 进程已结束,退出代码1 怎么解决
时间: 2023-08-05 16:09:20 浏览: 59
根据错误信息显示,程序无法找到文件 "C:/Users/1028/Desktop/r/tcga_data/HNSC/ml_input.csv"。请确保该文件存在,并且路径正确。可以使用以下方法来解决这个问题:
1. 验证文件路径:确认文件 "ml_input.csv" 是否位于 "C:/Users/1028/Desktop/r/tcga_data/HNSC/" 目录下。
2. 检查文件名和文件扩展名的拼写:确保文件名和文件扩展名正确,以及大小写是否匹配。
3. 检查文件权限:确保程序具有读取该文件的权限。
4. 如果文件不在指定的路径下,请根据实际路径修改 `train_path` 的值,确保它指向正确的文件。
如果以上步骤都正确无误,但问题仍然存在,请提供更多关于文件路径和文件结构的信息,以便我能够更好地帮助你解决问题。
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优化这段代码import os dir_path = "C:/Users/1028/Desktop/r" dir_py = os.listdir(dir_path) cancer='HNSC'#设置变量 train=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\ml_input.csv") target=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\tab_label.csv",index_col=0).values.ravel()#index_col=0表示将第一列作为索引列 indices = train.columns[2:]#提取索引,从第三列开始(索引2) train=train.iloc[:,2:].T.values#选择所有行和从第三列开始的所有列。然后通过.T进行转置操作,将数据框转换为NumPy数组
你可以稍微优化一下代码,将文件路径的拼接部分提取出来,避免重复写入。另外,还可以使用`numpy`库的`genfromtxt`函数来读取CSV文件,以简化读取和转置操作。以下是优化后的代码:
```python
import os
import pandas as pd
import numpy as np
dir_path = "C:/Users/1028/Desktop/r"
cancer = 'HNSC'
data_dir = os.path.join(dir_path, "tcga_data", cancer)
train_path = os.path.join(data_dir, "ml_input.csv")
label_path = os.path.join(data_dir, "tab_label.csv")
train = np.genfromtxt(train_path, delimiter=',', skip_header=1)
target = pd.read_csv(label_path, index_col=0).values.ravel()
indices = train[:, 2:].T
train = train[:, 2:].T
```
在这个例子中,我们使用`os.path.join`函数来拼接文件路径,然后使用`np.genfromtxt`函数来读取CSV文件并跳过标题行。最后,我们使用`.T`转置操作来得到索引和训练数据。请确保文件路径正确,并且你已经安装了所需的库(如pandas和numpy)。
FileNotFoundError: C:/Users/1028/Desktop/r/tcga_data/THCA\tcga_data\HNSC\ml_input.csv not found.
根据错误信息,它显示找不到文件 "C:/Users/1028/Desktop/r/tcga_data/THCA/tcga_data/HNSC/ml_input.csv"。请注意,路径中出现了两次 "tcga_data" 文件夹。
请检查代码中的路径拼接部分,确保每个路径都是正确的。
例如,你可以尝试使用以下代码进行路径拼接:
```python
dir_path = "C:/Users/1028/Desktop/r"
cancer = 'HNSC'
data_dir = os.path.join(dir_path, "tcga_data", cancer)
train_path = os.path.join(data_dir, "ml_input.csv")
label_path = os.path.join(data_dir, "tab_label.csv")
```
请确保变量 `cancer` 的值与文件夹名称匹配,并且确保文件 "ml_input.csv" 存在于正确的位置。如果问题仍然存在,请提供更多关于文件路径和文件结构的信息,以便我能够更好地帮助你解决问题。