FileNotFoundError: C:/Users/1028/Desktop/r/tcga_data/THCA\tcga_data\HNSC\ml_input.csv not found.
时间: 2023-12-12 21:02:29 浏览: 75
根据错误信息,它显示找不到文件 "C:/Users/1028/Desktop/r/tcga_data/THCA/tcga_data/HNSC/ml_input.csv"。请注意,路径中出现了两次 "tcga_data" 文件夹。
请检查代码中的路径拼接部分,确保每个路径都是正确的。
例如,你可以尝试使用以下代码进行路径拼接:
```python
dir_path = "C:/Users/1028/Desktop/r"
cancer = 'HNSC'
data_dir = os.path.join(dir_path, "tcga_data", cancer)
train_path = os.path.join(data_dir, "ml_input.csv")
label_path = os.path.join(data_dir, "tab_label.csv")
```
请确保变量 `cancer` 的值与文件夹名称匹配,并且确保文件 "ml_input.csv" 存在于正确的位置。如果问题仍然存在,请提供更多关于文件路径和文件结构的信息,以便我能够更好地帮助你解决问题。
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优化这段代码import os dir_path = "C:/Users/1028/Desktop/r" dir_py = os.listdir(dir_path) cancer='HNSC'#设置变量 train=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\ml_input.csv") target=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\tab_label.csv",index_col=0).values.ravel()#index_col=0表示将第一列作为索引列 indices = train.columns[2:]#提取索引,从第三列开始(索引2) train=train.iloc[:,2:].T.values#选择所有行和从第三列开始的所有列。然后通过.T进行转置操作,将数据框转换为NumPy数组
你可以稍微优化一下代码,将文件路径的拼接部分提取出来,避免重复写入。另外,还可以使用`numpy`库的`genfromtxt`函数来读取CSV文件,以简化读取和转置操作。以下是优化后的代码:
```python
import os
import pandas as pd
import numpy as np
dir_path = "C:/Users/1028/Desktop/r"
cancer = 'HNSC'
data_dir = os.path.join(dir_path, "tcga_data", cancer)
train_path = os.path.join(data_dir, "ml_input.csv")
label_path = os.path.join(data_dir, "tab_label.csv")
train = np.genfromtxt(train_path, delimiter=',', skip_header=1)
target = pd.read_csv(label_path, index_col=0).values.ravel()
indices = train[:, 2:].T
train = train[:, 2:].T
```
在这个例子中,我们使用`os.path.join`函数来拼接文件路径,然后使用`np.genfromtxt`函数来读取CSV文件并跳过标题行。最后,我们使用`.T`转置操作来得到索引和训练数据。请确保文件路径正确,并且你已经安装了所需的库(如pandas和numpy)。
这个错误是什么原因Traceback (most recent call last): File "C:\Users\1028\Desktop\r_Python\Python\main.py", line 94, in <module> train=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\ml_input.csv") ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py", line 912, in read_csv return _read(filepath_or_buffer, kwds) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py", line 577, in _read parser = TextFileReader(filepath_or_buffer, **kwds) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py", line 1407, in __init__ self._engine = self._make_engine(f, self.engine) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py", line 1661, in _make_engine self.handles = get_handle( ^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\pandas\io\common.py", line 859, in get_handle handle = open( ^^^^^ FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'C:/Users/1028/Desktop/r_Python\\tcga_data\\HNSC\\ml_input.csv' 进程已结束,退出代码1
根据错误信息可以看出,出现了`FileNotFoundError`,即文件未找到错误。具体的错误信息是:
`FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'C:/Users/1028/Desktop/r_Python\\tcga_data\\HNSC\\ml_input.csv'`
这个错误的原因是指定的文件路径不正确或者文件不存在。解决这个问题的方法是检查以下几个方面:
1. 确保文件路径正确:检查`dir_py`、`cancer`和文件名`ml_input.csv`是否正确。在错误信息中可以看到,指定的文件路径为`'C:/Users/1028/Desktop/r_Python\\tcga_data\\HNSC\\ml_input.csv'`,请确保这个路径下的文件存在,并且文件名正确。
2. 检查文件是否存在:在指定的文件路径下,确保文件`ml_input.csv`存在。如果文件不存在,将会引发`FileNotFoundError`错误。
3. 检查文件的读取权限:确保你拥有足够的权限来读取指定的文件。如果没有读取权限,也会导致文件未找到错误。
请根据上述建议检查文件路径和文件是否存在,并确保你有读取文件的权限。如果问题仍然存在,请进一步调查文件路径和文件是否正确。
希望能帮助到你!如有更多问题,请随时提问。
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