Error: Cannot open file for writing: * 'C:/Users/y'y'c/Desktop/代码及数据/TCGA/DEG/table/LUAD_anno.tsv'

时间: 2023-10-31 19:41:30 浏览: 225
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开源数据集资源汇总 数据集下载汇总

这个错误是由于文件路径中包含了单引号，导致文件无法打开。你可以将路径改为不包含单引号的形式，例如将路径改为：`C:/Users/yyc/Desktop/代码及数据/TCGA/DEG/table/LUAD_anno.tsv`。或者将路径用双引号括起来，例如`"C:/Users/y'y'c/Desktop/代码及数据/TCGA/DEG/table/LUAD_anno.tsv"`。
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Error in file(file, "rt") : cannot open the connection In addition: Warning message: In file(file, "rt") : cannot open file 'TCGA生存资料+miRNA表达矩阵-去重-副本.txt': No such file or directory

The error message you're seeing suggests that there is a problem opening a file named 'TCGA生存资料+miRNA表达矩阵-去重-副本.txt' because it doesn't exist or the file path is incorrect. Please make ...

FileNotFoundError: C:/Users/1028/Desktop/r/tcga_data/THCA\tcga_data\HNSC\ml_input.csv not found.

根据错误信息，它显示找不到文件 "C:/Users/1028/Desktop/r/tcga_data/THCA/tcga_data/HNSC/ml_input.csv"。请注意，路径中出现了两次 "tcga_data" 文件夹。 请检查代码中的路径拼接部分，确保每个路径都是正确的。...
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No such file or directory: '/media/ubuntu/1276A91876A8FD9B/zy/npy/ori/TCGA-IB-A5SQ'

"No such file or directory"是一个常见的错误提示，它表示指定的文件或目录不存在。在你提供的路径中，'/media/ubuntu/1276A91876A8FD9B/zy/npy/ori/TCGA-IB-A5SQ'这个文件或目录不存在。 可能的原因有： 1. 文件...

这段程序import os dir_path = "C:/Users/1028/Desktop/r" cancer='HNSC'#设置变量 data_dir = os.path.join(dir_path, "tcga_data", cancer) train_path = os.path.join(data_dir, "ml_input.csv") label_path = os.path.join(data_dir, "tab_label.csv") train = np.genfromtxt(train_path, delimiter=',', skip_header=1) target = pd.read_csv(label_path, index_col=0).values.ravel() indices = train[:, 2:].T train = train[:, 2:].T的这个错误C:\Users\1028\Desktop\python\python.exe C:\Users\1028\Desktop\r_Python\Python\main.py Traceback (most recent call last): File "C:\Users\1028\Desktop\r_Python\Python\main.py", line 105, in <module> train = np.genfromtxt(train_path, delimiter=',', skip_header=1) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\numpy\lib\npyio.py", line 1980, in genfromtxt fid = np.lib._datasource.open(fname, 'rt', encoding=encoding) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\numpy\lib\_datasource.py", line 193, in open return ds.open(path, mode, encoding=encoding, newline=newline) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\numpy\lib\_datasource.py", line 533, in open raise FileNotFoundError(f"{path} not found.") FileNotFoundError: C:/Users/1028/Desktop/r\tcga_data\HNSC\ml_input.csv not found. 进程已结束,退出代码1 怎么解决

根据错误信息显示，程序无法找到文件 "C:/Users/1028/Desktop/r/tcga_data/HNSC/ml_input.csv"。请确保该文件存在，并且路径正确。可以使用以下方法来解决这个问题： 1. 验证文件路径：确认文件 "ml_input.csv" ...

[Errno 2] No such file or directory: '../media/ubuntu/1276A91876A8FD9B/zy/npy/ori/TCGA-IB-A5SQ'

[Errno 2] No such file or directory 是一个常见的错误提示，它表示在指定的路径下找不到文件或目录。具体来说，'../media/ubuntu/1276A91876A8FD9B/zy/npy/ori/TCGA-IB-A5SQ' 这个路径下的文件或目录不存在。 ...

ciber <- CIBERSORT(sig_matrix = "E:/GSVA/CIBERSORT/LM22.txt", + mixture_file = "E:/GSVA/TCGA_SKCM.exp.txt", + perm = 100, + QN = TRUE) Error in write.table(rbind(header, output), saveLocation, sep = "\t", : argument "saveLocation" is missing, with no default

这个错误是因为在你的代码中，write.table函数需要一个参数saveLocation，但是你没有提供它。你需要指定要将结果写入的文件路径和文件名，例如： write.table(rbind(header, output), "output.txt", sep = ...

这个错误是什么原因Traceback (most recent call last): File "C:\Users\1028\Desktop\r_Python\Python\main.py", line 94, in <module> train=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\ml_input.csv") ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py", line 912, in read_csv return _read(filepath_or_buffer, kwds) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py", line 577, in _read parser = TextFileReader(filepath_or_buffer, **kwds) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py", line 1407, in __init__ self._engine = self._make_engine(f, self.engine) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py", line 1661, in _make_engine self.handles = get_handle( ^^^^^^^^^^^ File "C:\Users\1028\Desktop\python\Lib\site-packages\pandas\io\common.py", line 859, in get_handle handle = open( ^^^^^ FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'C:/Users/1028/Desktop/r_Python\\tcga_data\\HNSC\\ml_input.csv' 进程已结束,退出代码1

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