在LASSO回归中,对于四分类因变量Y数据,自变量X数据怎样行交叉验证,并输出图片?请给R代码
时间: 2024-05-14 10:14:21 浏览: 73
以下是对四分类因变量Y数据进行LASSO回归交叉验证的R代码,并输出相关图片:
```
# 加载必要的库
library(glmnet)
library(pROC)
library(ggplot2)
# 读取数据
data <- read.csv("data.csv")
# 将因变量Y转换为因子变量
data$Y <- as.factor(data$Y)
# 分割数据集为训练集和测试集
set.seed(123)
train_index <- sample(1:nrow(data), 0.8 * nrow(data))
train_data <- data[train_index, ]
test_data <- data[-train_index, ]
# 将自变量X和因变量Y分离
x_train <- as.matrix(train_data[, -1])
y_train <- train_data[, 1]
# 设置LASSO回归模型
lasso_model <- cv.glmnet(x_train, y_train, alpha = 1, nfolds = 10)
# 输出交叉验证中最优的lambda值
best_lambda <- lasso_model$lambda.min
print(paste("Best lambda value: ", best_lambda))
# 使用最优的lambda值生成LASSO回归模型
final_model <- glmnet(x_train, y_train, alpha = 1, lambda = best_lambda)
# 对测试集进行预测
x_test <- as.matrix(test_data[, -1])
y_test <- test_data[, 1]
y_pred <- predict(final_model, newx = x_test, s = best_lambda, type = "class")
# 计算模型的性能指标
roc <- roc(y_test, y_pred)
auc <- auc(roc)
acc <- mean(y_test == y_pred)
print(paste("AUC: ", auc))
print(paste("Accuracy: ", acc))
# 绘制ROC曲线
ggplot2::ggroc(roc) +
ggplot2::geom_line() +
ggplot2::geom_abline(slope = 1, intercept = 0, linetype = "dashed") +
ggplot2::labs(x = "False Positive Rate", y = "True Positive Rate", title = "ROC Curve")
# 绘制混淆矩阵
confusion_matrix <- table(y_test, y_pred)
ggplot2::ggplot2(confusion_matrix, ggplot2::aes(x = y_test, y = y_pred, fill = factor(..count..))) +
ggplot2::geom_tile() +
ggplot2::scale_fill_gradient(low = "white", high = "steelblue") +
ggplot2::geom_text(ggplot2::aes(label = ifelse(..count.. > 0, ..count.., ""))) +
ggplot2::theme(axis.text.x = ggplot2::element_text(angle = 45, hjust = 1)) +
ggplot2::labs(x = "True label", y = "Predicted label", title = "Confusion Matrix")
```
在以上代码中,我们首先读取数据并将因变量Y转换为因子变量。然后,我们将数据分为训练集和测试集,并将自变量X和因变量Y分离。接着,我们使用`cv.glmnet`函数进行10折交叉验证来选择最优的lambda值,并使用`glmnet`函数生成最终的LASSO回归模型。我们使用`predict`函数对测试集进行预测,并计算模型的性能指标。最后,我们绘制ROC曲线和混淆矩阵来评估模型的性能。
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