那你可以采用空间分割法帮我改写一下吗
时间: 2024-03-25 10:39:52 浏览: 20
好的,以下是一个基于空间分割法的Fortran代码片段,可以用于计算分子系统中原子之间的相互作用能量:
```
! 定义立方体大小和分子数
L = 10.d0
n_mol = 100
! 定义立方体边长
box_size = L/n_mol
! 定义每个立方体所包含的原子
type atom_type
real, dimension(3) :: r
end type atom_type
type(atom_type), dimension(n_mol,n_mol,n_mol) :: atom_list
! 循环遍历所有原子,将其放入对应的立方体中
do i = 1, n_atoms
ix = int(xu(i)/box_size) + 1
iy = int(yu(i)/box_size) + 1
iz = int(zu(i)/box_size) + 1
atom_list(ix,iy,iz)%r = [xu(i), yu(i), zu(i)]
end do
! 循环遍历所有立方体,计算处于同一或相邻立方体中的原子对之间的相互作用能量
E_pe_tot = 0.d0
do i = 1, n_mol
do j = 1, n_mol
do k = 1, n_mol
do l = i, n_mol
do m = 1, n_mol
do n = 1, n_mol
if (abs(i-l)<=1 .and. abs(j-m)<=1 .and. abs(k-n)<=1) then
! 计算该立方体中所有原子对之间的相互作用能量
do ii = 1, size(atom_list(i,j,k))
do jj = 1, size(atom_list(l,m,n))
if (i/=l .or. j/=m .or. k/=n) then
dx = atom_list(i,j,k)%r(1) - atom_list(l,m,n)%r(1)
dy = atom_list(i,j,k)%r(2) - atom_list(l,m,n)%r(2)
dz = atom_list(i,j,k)%r(3) - atom_list(l,m,n)%r(3)
dis = sqrt(dx ** 2 + dy ** 2 + dz ** 2)
if (dis < radius(i) + radius(l)) then
delta_d = (radius(i) + radius(l) - dis)
r_eff = sqrt(radius(i) * radius(l) / (radius(i) + radius(l)))
E_pe = 0.4d0 * r_eff * Kn * (delta_d ** 2.5)
E_pe_tot = E_pe_tot + E_pe
end if
end if
end do
end do
end if
end do
end do
end do
end do
end do
end do
```
在这个代码中,我们首先定义了立方体的大小和分子数,然后将立方体边长设为L/n_mol,将每个原子放入对应的立方体中。接下来,我们循环遍历所有立方体,计算处于同一或相邻立方体中的原子对之间的相互作用能量。在计算过程中,我们只计算处于同一或相邻立方体中的原子对之间的相互作用,避免了对所有原子对之间的相互作用进行计算,从而提高了计算效率。
需要注意的是,该代码仅仅是一个示例代码,实际应用中还需要根据具体情况进行适当的修改和优化。