p_boxplot_exp_mt.gene Don't know how to automatically pick scale for object of type <function>. Defaulting to continuous. Error in `geom_boxplot()`: ! Problem while computing aesthetics. ℹ Error occurred in the 1st layer. Caused by error in `compute_aesthetics()`: ! Aesthetics are not valid data columns. ✖ The following aesthetics are invalid: ✖ `y = expression` ℹ Did you mistype the name of a data column or forget to add `after_stat()`? Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.

这个错误可能是由于以下原因之一引起的：

1. `p_boxplot_exp_mt.gene` 函数的返回值中可能存在问题，导致无法正确计算箱线图的美学属性。请检查函数的输出，确保它是一个正确的数据框，并且包含用于绘制箱线图的正确的列名。

2. `ggplot2` 无法自动为函数选择比例尺，因此需要手动指定比例尺。你可以使用 `scale_*()` 函数，例如 `scale_x_continuous()` 或 `scale_y_continuous()`，根据情况指定比例尺。

3. 错误消息中提到的 `aesthetics` 无效，可能是因为你使用了 `expression` 函数作为 `y` 美学属性的值。 `ggplot2` 不支持在 `aes()` 函数中使用 `expression` 函数，因为它不是一个有效的数据列。请确保将数据列的名称传递给 `y` 美学属性。

你可以使用 `rlang::last_trace()` 函数查看详细的错误信息和堆栈跟踪，以找出导致错误的确切原因。

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p_boxplot_exp_mt.gene Don't know how to automatically pick scale for object of type <function>. Defaulting to continuous. Don't know how to automatically pick scale for object of type <function>. Defaulting to continuous. Don't know how to automatically pick scale for object of type <function>. Defaulting to continuous. Error in `geom_boxplot()`: ! Problem while computing aesthetics. ℹ Error occurred in the 1st layer. Caused by error in `aesthetics[[nondata_cols]]`: ! no such index at level 2 Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.

这个错误可能是由于以下原因之一引起的：

1. `p_boxplot_exp_mt.gene` 是一个函数，而不是数据框，因此无法在 `ggplot()` 中使用。请确保你传递了正确的数据框作为 `ggplot()` 的第一个参数。

2. `ggplot2` 无法自动为函数选择比例尺，因此需要手动指定比例尺。你可以使用 `scale_*()` 函数，例如 `scale_x_continuous()` 或 `scale_y_continuous()`，根据情况指定比例尺。

3. 错误消息中提到的 `aesthetics` 可能有问题。请检查你在 `aes()` 函数中使用的变量是否存在，或者是否在正确的数据框中。

你可以使用 `rlang::last_trace()` 函数查看详细的错误信息和堆栈跟踪，以找出导致错误的确切原因。

df_boxplot_exp_mt.gene <- as.data.frame(p_boxplot_exp_mt.gene)

这行代码是将 `p_boxplot_exp_mt.gene` 对象转换为数据框对象 `df_boxplot_exp_mt.gene`。这是因为 `ggplot2` 绘图函数需要数据框作为输入，而 `boxplot` 函数的输出结果是一个列表，不方便直接用于绘图。

转换为数据框后，您就可以使用 `ggplot` 函数对数据进行可视化。常见的数据可视化函数包括 `ggplot`、`plot`、`hist`、`boxplot` 等，它们都是 R 语言中常用的数据可视化函数。其中，`ggplot2` 包提供了强大的绘图功能，可以绘制高质量的图形，因此被广泛使用。