> split -n 5 temp/filtered.fa filtered_part_ Error: unexpected numeric constant in "split -n 5"

这个错误可能是因为你使用的是Windows系统，而`split`命令在Windows系统上不被支持。在Windows系统上，你可以使用PowerShell来代替`split`命令，或者安装一些第三方工具来提供类似于`split`命令的功能。以下是使用PowerShell来分割文件的示例代码：

# 将filtered.fa文件分割成5个部分
Get-Content temp/filtered.fa | Split-Content -Count 5 -Prefix filtered_part_

# 对每个部分进行去冗余操作
foreach ($file in Get-ChildItem filtered_part_*)
{
    vsearch --derep_fulllength $file.FullName `
            --minuniquesize 20 `
            --sizeout `
            --relabel Uni_ `
            --output ($file.FullName -replace "_part_", "_uniques_")
}

# 合并所有去冗余后的结果
Get-ChildItem temp/un/*_uniques_*.fa | Get-Content | Set-Content temp/un/uniques.fa

# 删除临时文件
Remove-Item filtered_part_* *_uniques_*.fa

在这段代码中，我们使用`Get-Content`命令读取输入文件的内容，然后使用`Split-Content`命令将其分割成5个部分。接下来，我们使用`foreach`循环遍历所有分割后的文件，并对每个文件运行vsearch命令进行去冗余操作。在输出文件的名称中，我们使用了`-replace`参数来将文件名中的"_part_"替换为"_uniques_"，以便正确地命名输出文件。然后，我们使用`Get-ChildItem`命令找到所有去冗余后的部分文件，并使用`Get-Content`和`Set-Content`命令将它们合并到名为uniques.fa的文件中。最后，我们使用`Remove-Item`命令删除所有临时文件。请注意，这段代码需要在PowerShell中运行，而不是在命令提示符中。