python mat文件的最近邻距离图
时间: 2023-10-08 20:06:34 浏览: 61
.mat和.txt格式的iris数据集
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要读取mat文件中的稀疏矩阵,并生成最近邻距离图,可以使用Python中的scipy库。下面是一个简单的示例代码:
```python
import scipy.io
from scipy.sparse import find
import matplotlib.pyplot as plt
# 读取mat文件中的稀疏矩阵
data = scipy.io.loadmat('distances.mat')
distances = data['distances']
# 将稀疏矩阵转换为对称矩阵
distances = distances + distances.T - np.diag(distances.diagonal())
# 获取距离矩阵中非零元素的坐标和值
row, col, val = find(distances)
# 绘制最近邻距离图
plt.scatter(row, col, c=val, cmap='coolwarm')
plt.colorbar()
plt.show()
```
这段代码中,首先使用`scipy.io.loadmat`函数读取mat文件中的稀疏矩阵。然后,将稀疏矩阵转换为对称矩阵,以便绘制距离图。接着,使用`find`函数获取距离矩阵中非零元素的坐标和值。最后,使用`scatter`函数绘制最近邻距离图,并使用`colorbar`函数添加颜色条。
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