单基因泛癌蛋白表达差异分析的数据库有哪些
时间: 2023-07-15 19:11:06 浏览: 189
基因注释相关的数据库
目前,常用的单基因泛癌蛋白表达差异分析数据库包括以下几个:
1. Oncomine(https://www.oncomine.com/):一个专门用于癌症基因表达谱的数据库,包含来自多个研究的RNA表达谱数据,可用于寻找差异表达的基因。
2. Gene Expression Profiling Interactive Analysis (GEPIA)(http://gepia.cancer-pku.cn/):一个在线分析工具,包含来自The Cancer Genome Atlas (TCGA)和Genotype-Tissue Expression (GTEx)数据库的RNA-Seq数据,可用于研究基因表达谱与癌症相关性。
3. cBioPortal(https://www.cbioportal.org/):一个在线的癌症基因组学分析平台,包含来自TCGA和其他癌症研究项目的多组学数据,包括RNA表达谱数据,可用于进行基因表达差异分析和功能注释等研究。
4. Tumor Immune Dysfunction and Exclusion (TIDE)(http://tide.dfci.harvard.edu/):一个用于预测肿瘤免疫治疗响应的在线工具,包含来自TCGA的RNA表达谱数据,可用于研究免疫相关基因的表达差异和影响。
以上这些数据库都是非常有用的工具,能够帮助研究人员对单基因泛癌蛋白的表达差异进行深入的分析和挖掘。
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