用python的hdf5库保存的mat文件,matio无法读取,有什么原因吗
时间: 2024-02-16 07:05:15 浏览: 30
可能是因为 Python 的 HDF5 库和 matio 读取 mat 文件的方式不同导致的。mat 文件是 MATLAB 所使用的二进制数据文件格式,但是 Python 的 HDF5 库保存 mat 文件时可能会加上一些 HDF5 文件的头部信息,使得 matio 无法正确读取。
建议在 Python 中使用 scipy 库的 io 模块来保存 mat 文件,这样可以保证保存的文件格式与 MATLAB 中的 mat 文件格式相同,从而可以被 matio 正确读取。具体操作可以参考以下示例代码:
```python
import scipy.io as sio
# 定义需要保存的数据
data = {'x': [1, 2, 3], 'y': [4, 5, 6]}
# 保存 mat 文件
sio.savemat('data.mat', data)
```
这样保存的 mat 文件可以被 matio 正确读取。如果还有问题,可以尝试查看具体的报错信息,或者寻求 matio 社区的支持。
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用python的hdf5storage保存的mat文件,无法在c++用matio读取,原因是什么
可能是因为 Python 的 hdf5storage 库和 matio 读取 mat 文件的方式不同导致的。hdf5storage 库保存的 mat 文件也是基于 HDF5 文件格式的,但是不同于 MATLAB 中的 mat 文件,因此可能会导致 matio 无法正确读取。
如果需要在 C++ 中使用 matio 读取 hdf5storage 库保存的 mat 文件,可以考虑使用 HDF5 库来读取。HDF5 库可以读取 hdf5storage 库保存的 mat 文件,因为它们都基于 HDF5 文件格式。
以下是一个使用 HDF5 库读取 mat 文件的示例代码:
```c++
#include <iostream>
#include <string>
#include <vector>
#include "hdf5.h"
int main() {
// 打开 HDF5 文件
hid_t file_id = H5Fopen("data.mat", H5F_ACC_RDONLY, H5P_DEFAULT);
if (file_id < 0) {
std::cerr << "Failed to open HDF5 file." << std::endl;
return -1;
}
// 获取MATLAB变量的名称列表
std::vector<std::string> var_names;
H5G_info_t group_info;
herr_t status = H5Gget_info(file_id, &group_info);
if (status >= 0) {
var_names.resize(group_info.nlinks);
for (unsigned int i = 0; i < group_info.nlinks; i++) {
char var_name[1024] = {0};
H5Lget_name_by_idx(file_id, ".", H5_INDEX_NAME, H5_ITER_INC, i, var_name, sizeof(var_name), H5P_DEFAULT);
var_names[i] = var_name;
}
}
// 读取变量
for (const auto& var_name : var_names) {
hid_t dataset_id = H5Dopen2(file_id, var_name.c_str(), H5P_DEFAULT);
if (dataset_id < 0) {
std::cerr << "Failed to open dataset: " << var_name << std::endl;
continue;
}
// 获取数据类型
hid_t datatype_id = H5Dget_type(dataset_id);
if (datatype_id < 0) {
std::cerr << "Failed to get datatype for dataset: " << var_name << std::endl;
H5Dclose(dataset_id);
continue;
}
// 获取数据空间
hid_t dataspace_id = H5Dget_space(dataset_id);
if (dataspace_id < 0) {
std::cerr << "Failed to get dataspace for dataset: " << var_name << std::endl;
H5Tclose(datatype_id);
H5Dclose(dataset_id);
continue;
}
// 获取数据维度
int ndims = H5Sget_simple_extent_ndims(dataspace_id);
if (ndims < 0) {
std::cerr << "Failed to get number of dimensions for dataset: " << var_name << std::endl;
H5Sclose(dataspace_id);
H5Tclose(datatype_id);
H5Dclose(dataset_id);
continue;
}
std::vector<hsize_t> dims(ndims);
H5Sget_simple_extent_dims(dataspace_id, dims.data(), NULL);
// 创建内存空间存储数据
std::vector<double> data(dims[0] * dims[1]);
hid_t mem_dataspace_id = H5Screate_simple(2, dims.data(), NULL);
// 读取数据
status = H5Dread(dataset_id, H5T_NATIVE_DOUBLE, mem_dataspace_id, dataspace_id, H5P_DEFAULT, data.data());
if (status < 0) {
std::cerr << "Failed to read dataset: " << var_name << std::endl;
} else {
std::cout << "Variable: " << var_name << std::endl;
for (int i = 0; i < dims[0]; i++) {
for (int j = 0; j < dims[1]; j++) {
std::cout << data[i * dims[1] + j] << " ";
}
std::cout << std::endl;
}
}
// 关闭数据集和数据空间
H5Sclose(mem_dataspace_id);
H5Sclose(dataspace_id);
H5Tclose(datatype_id);
H5Dclose(dataset_id);
}
// 关闭 HDF5 文件
H5Fclose(file_id);
return 0;
}
```
注意,在使用 HDF5 库读取 mat 文件时需要先打开 HDF5 文件,然后获取 MATLAB 变量的名称列表,再逐个读取变量。具体的读取操作可以参考上述示例代码。
如果以上方法仍然无法解决问题,可以考虑查看具体的报错信息或者寻求 hdf5storage 和 matio 社区的支持。
python使用hdf5读取mat文件的变量内容
在Python中,可以使用`h5py`库来读取`.mat`文件内容。以下是一个示例代码,演示如何读取`.mat`文件中的变量内容:
```python
import h5py
# 打开 .mat 文件
mat_file = h5py.File('example.mat', 'r')
# 读取变量内容
var_data = mat_file['variable_name'][:]
# 关闭文件
mat_file.close()
```
其中,`variable_name`是要读取的变量名称。注意使用`[:]`来获取变量的值。
如果`.mat`文件中有多个变量,可以使用`.keys()`方法来获取所有变量的名称列表。例如:
```python
import h5py
# 打开 .mat 文件
mat_file = h5py.File('example.mat', 'r')
# 获取所有变量名称
var_names = list(mat_file.keys())
# 依次读取每个变量
for var_name in var_names:
var_data = mat_file[var_name][:]
print(var_name, var_data)
# 关闭文件
mat_file.close()
```
这样就可以读取`.mat`文件中所有变量的内容了。