使用Astra对多张二维锥束扫描切片数据进行FDK重建python
时间: 2024-05-03 17:22:27 浏览: 315
锥束FDK重建算法
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在进行多张二维锥束扫描切片数据的FDK重建之前,需要先安装Astra工具包。以下是使用Astra对多张二维锥束扫描切片数据进行FDK重建的Python代码示例:
```python
import numpy as np
import astra
# 设置重建参数
num_slices = 100 # 切片数
num_angles = 180 # 角度数
det_count = 256 # 探测器数量
det_size = 1.0 # 探测器尺寸
vol_shape = (256, 256, 100) # 体素形状
vol_origin = (0, 0, -100) # 体素原点
vol_spacing = (1, 1, 1) # 体素间距
# 生成投影数据
proj_data = np.random.rand(num_angles, det_count)
# 创建几何体
proj_geom = astra.create_proj_geom('cone', det_size / 2, det_size / 2, -det_count / 2, det_count / 2,
np.linspace(0, np.pi, num_angles, False), 1000, 0)
vol_geom = astra.create_vol_geom(vol_shape, vol_origin, vol_spacing)
# 创建投影ID
proj_id = astra.create_projector('cuda', proj_geom, vol_geom)
# 创建重建ID
recon_id = astra.data3d.create('-vol', vol_geom)
# 进行FDK重建
astra.data3d.fdk(proj_id, proj_data, recon_id)
# 获取重建结果
recon_data = astra.data3d.get(recon_id)
# 显示重建结果
import matplotlib.pyplot as plt
plt.imshow(recon_data[:, :, 50], cmap='gray')
plt.show()
```
在代码中,我们首先设置了重建参数,包括切片数、角度数、探测器数量、探测器尺寸、体素形状、体素原点和体素间距。然后,我们生成了随机投影数据,并创建了投影和体积的几何体。接着,我们创建了投影和重建的ID,并使用`astra.data3d.fdk`函数进行FDK重建。最后,我们获取了重建结果,并使用matplotlib库显示了重建图像。
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