编写一个Java应用程序，在主线程中再创建两个线程，一个线程负责给出键盘上字母键上的字母，另一个线程负责用户在命令行中输入所给出的字母。

以下是一个可能的Java应用程序，其中包括一个主线程和两个子线程，一个用于读取键盘上的字母，另一个用于读取命令行输入。

import java.util.Scanner;

public class KeyboardInputThread extends Thread {

    @Override
    public void run() {
        Scanner scanner = new Scanner(System.in);
        String input = scanner.next();
        System.out.println("You typed: " + input);
    }
}

public class CommandLineInputThread extends Thread {

    private String letter;

    public CommandLineInputThread(String letter) {
        this.letter = letter;
    }

    @Override
    public void run() {
        Scanner scanner = new Scanner(System.in);
        String input = scanner.next();
        if (input.equals(letter)) {
            System.out.println("Correct!");
        } else {
            System.out.println("Incorrect!");
        }
    }
}

public class MainThread {

    public static void main(String[] args) {
        KeyboardInputThread keyboardInputThread = new KeyboardInputThread();
        CommandLineInputThread commandLineInputThread = new CommandLineInputThread("a");

        keyboardInputThread.start();
        commandLineInputThread.start();
    }
}

在这个例子中，`KeyboardInputThread`类继承了`Thread`类，并覆盖了其`run()`方法。在`run()`方法中，它使用`Scanner`类从键盘中读取用户输入，并将其输出到控制台。

`CommandLineInputThread`类也继承了`Thread`类，并使用了一个构造函数来传递要匹配的字母。在`run()`方法中，它读取命令行输入并检查它是否与传递的字母匹配，并将结果输出到控制台。

在`MainThread`类中，我们创建了一个`KeyboardInputThread`实例和一个`CommandLineInputThread`实例，并分别启动它们的线程。这将导致两个子线程同时运行，并在后台读取用户输入。当用户在键盘上输入字母时，`KeyboardInputThread`子线程将会输出它，而当用户在命令行中输入字母时，`CommandLineInputThread`子线程将会检查它是否与预期的字母匹配，并输出相应的结果。