class MLP(nn.Module): def __init__( self, input_size: int, output_size: int, n_hidden: int, classes: int, dropout: float, normalize_before: bool = True ): super(MLP, self).__init__() self.input_size = input_size self.dropout = dropout self.n_hidden = n_hidden self.classes = classes self.output_size = output_size self.normalize_before = normalize_before self.model = nn.Sequential( nn.Linear(self.input_size, n_hidden), nn.Dropout(self.dropout), nn.ReLU(), nn.Linear(n_hidden, self.output_size), nn.Dropout(self.dropout), nn.ReLU(), ) self.after_norm = torch.nn.LayerNorm(self.input_size, eps=1e-5) self.fc = nn.Sequential( nn.Dropout(self.dropout), nn.Linear(self.input_size, self.classes) ) self.output_layer = nn.Linear(self.output_size, self.classes) def forward(self, x): self.device = torch.device('cuda') # x = self.model(x) if self.normalize_before: x = self.after_norm(x) batch_size, length, dimensions = x.size(0), x.size(1), x.size(2) output = self.model(x) return output.mean(dim=1) class LabelSmoothingLoss(nn.Module): def __init__(self, size: int, smoothing: float, ): super(LabelSmoothingLoss, self).__init__() self.size = size self.criterion = nn.KLDivLoss(reduction="none") self.confidence = 1.0 - smoothing self.smoothing = smoothing def forward(self, x: torch.Tensor, target: torch.Tensor) -> torch.Tensor: batch_size = x.size(0) if self.smoothing == None: return nn.CrossEntropyLoss()(x, target.view(-1)) true_dist = torch.zeros_like(x) true_dist.fill_(self.smoothing / (self.size - 1)) true_dist.scatter_(1, target.view(-1).unsqueeze(1), self.confidence) kl = self.criterion(torch.log_softmax(x, dim=1), true_dist) return kl.sum() / batch_size

时间: 2024-02-14 14:19:09 浏览: 181
这段代码中定义了一个 MLP 模型以及一个 LabelSmoothingLoss 损失函数。MLP 模型包含了多个线性层和 ReLU 激活函数,以及一个 LayerNorm 层和一个 dropout 层。LabelSmoothingLoss 损失函数主要用于解决分类问题中的过拟合问题,它通过对真实标签进行平滑处理来减少模型对噪声的敏感度。这段代码的 forward 方法实现了 MLP 模型的前向传播,以及 LabelSmoothingLoss 的计算。其中,true_dist 是经过平滑处理后的真实标签分布,kl 是计算 KL 散度的结果,最终返回的是 kl 的平均值。
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self.SA_modules.append( nn.Sequential( PointnetSAModuleMSG( npoint=cfg.RPN.SA_CONFIG.NPOINTS[k], radii=cfg.RPN.SA_CONFIG.RADIUS[k], nsamples=cfg.RPN.SA_CONFIG.NSAMPLE[k], mlps=mlps, use_xyz=use_xyz, bn=cfg.RPN.USE_BN ), SelfAttention(channel_out) ) )这是SA_modules的定义代码块,而 for i in range(len(self.SA_modules)): li_xyz, li_features = self.SA_modules[i](l_xyz[i], l_features[i]) l_xyz.append(li_xyz) l_features.append(li_features)是SA_modules的调用代码块,运行时程序报错提示: File "/root/autodl-tmp/project/tools/../lib/net/pointnet2_msg.py", line 154, in forward li_xyz, li_features = self.SA_modules[i](l_xyz[i], l_features[i]) File "/root/miniconda3/lib/python3.8/site-packages/torch/nn/modules/module.py", line 727, in _call_impl result = self.forward(*input, **kwargs) TypeError: forward() takes 2 positional arguments but 3 were given,我想我必须得传入三个参数给SA_modules,第三个参数应该是channel_out,我该如何解决该问题,请给出详细的代码

根据错误提示,`forward()` 方法只接受两个位置参数,但是在调用 `self.SA_modules[i]` 方法时,您传递了三个参数。根据您提供的代码,这个错误来自于 `SelfAttention(channel_out)` 这一行。因此,可以尝试在 `SelfAttention` 类的 `forward()` 方法中添加一个额外的参数。 以下是一个可能的解决方案: ``` class SelfAttention(nn.Module): def __init__(self, in_channels, out_channels): super().__init__() self.conv1 = nn.Conv1d(in_channels, out_channels, 1) self.conv2 = nn.Conv1d(out_channels, out_channels, 1) self.conv3 = nn.Conv1d(out_channels, out_channels, 1) self.softmax = nn.Softmax(dim=-1) self.bn = nn.BatchNorm1d(out_channels) def forward(self, xyz, features, channel_out): """ :param xyz: (B, N, 3) :param features: (B, C, N) :param channel_out: (int) number of output channels :return: updated features """ B, C, N = features.size() xyz = xyz.permute(0, 2, 1) # (B, 3, N) q = self.conv1(features) # (B, channel_out, N) k = self.conv2(features) # (B, channel_out, N) v = self.conv3(features) # (B, channel_out, N) attn = torch.bmm(k.permute(0, 2, 1), q) # (B, N, N) attn = self.softmax(attn) features = torch.bmm(v, attn.permute(0, 2, 1)) # (B, C, N) features = self.bn(features) return features ``` 然后,在 `PointnetSAModuleMSG` 中,您需要将 `SelfAttention` 的 `forward()` 方法的第三个参数设置为 `channel_out`,如下所示: ``` class PointnetSAModuleMSG(nn.Module): def __init__(self, npoint, radii, nsamples, mlps, use_xyz=True, bn=True): super().__init__() self.npoint = npoint self.radii = radii self.nsamples = nsamples self.use_xyz = use_xyz self.bn = bn self.mlp_convs = nn.ModuleList() self.sa_modules = nn.ModuleList() last_channel = mlps[-1] for out_channel in mlps: self.mlp_convs.append(nn.Conv1d(last_channel, out_channel, 1)) last_channel = out_channel for i in range(len(radii)): sa_module = nn.Sequential( PointnetSAModule(npoint[i], radii[i], nsamples[i], mlps[:-1], use_xyz, bn), SelfAttention(mlps[-1], mlps[-1]) # <-- add this line ) self.sa_modules.append(sa_module) def forward(self, xyz, features): new_xyz, new_features = sample_and_group_all(xyz, features) # (B, 1, 3), (B, C, 1) l_xyz, l_features = [new_xyz], [new_features] for i in range(len(self.radii)): li_xyz, li_features = sample_and_group_radius(xyz, features, self.npoint[i], self.radii[i], self.nsamples[i], self.use_xyz) # (B, npoint[i], 3), (B, C, npoint[i], nsamples[i]) li_features = li_features.view(li_features.size(0), li_features.size(1), -1) # (B, C, npoint[i] * nsamples[i]) li_features = self.mlp_convs[i](li_features) # (B, mlps[i], npoint[i] * nsamples[i]) li_xyz, li_features = self.sa_modules[i](li_xyz, li_features, mlps[-1]) # <-- add mlps[-1] here l_xyz.append(li_xyz) l_features.append(li_features) return l_xyz, l_features ``` 这应该可以解决您遇到的问题。

你现在利用pytorch定义了两个神经网络,一个是3层用全连接层构造成的MLP,还有一个是图注意力网络。两个输出均是(16,307,12)。你现在需要把这两个神经网络作为VAE的两个编码器,将它们的输出拼接后计算隐变量,然后解码生成新的交通数据集。这个pytorch应该怎么写,请给我一个比较完整的pytorch代码。原来的数据集形状为(16992,307,12,3)的数据集,其中,16992是时间段数,307是传感器节点个数,12是历史步长,3是特征维度。第一个特征维度是速度,第二个特征维度是根据邻接矩阵产生的度特征,第三个特征维度是星期。现在按照batch_size=16送入模型得到的输出均是(16,307,12),并最好告诉我每一行在做什么,相应输出维度应该是什么。两个class均不想删除,那decoder怎么写,两个输入参数是不一样的,例如MLP的相关参数是input_dim = 36,hidden_dim = 64,output_dim = 12,history_length=12,GAT的相关参数是num_heads = 8,in_dim = 3,hidden_dim = 64,out_dim = 36,输出维度是相同的。最后,请随机生成形状为(16992,307,12,3)的数据集,按批次送入模型,让我自行看看模型的效果

好的,以下是一个比较完整的PyTorch代码,实现了VAE的编码器和解码器部分,其中编码器部分使用了两个神经网络,分别是MLP和GAT网络: ```python import torch import torch.nn as nn import torch.nn.functional as F from torch.autograd import Variable from torch.utils.data import Dataset, DataLoader # 定义MLP网络 class MLP(nn.Module): def __init__(self, input_dim, hidden_dim, output_dim, history_length): super(MLP, self).__init__() self.fc1 = nn.Linear(input_dim * history_length, hidden_dim) self.fc21 = nn.Linear(hidden_dim, output_dim) self.fc22 = nn.Linear(hidden_dim, output_dim) def encode(self, x): x = x.view(x.size(0), -1) h1 = F.relu(self.fc1(x)) return self.fc21(h1), self.fc22(h1) def forward(self, x): mu, logvar = self.encode(x) std = torch.exp(0.5 * logvar) eps = torch.randn_like(std) return eps.mul(std).add_(mu), mu, logvar # 定义GAT网络 class GAT(nn.Module): def __init__(self, num_heads, in_dim, hidden_dim, out_dim): super(GAT, self).__init__() self.num_heads = num_heads self.fc = nn.Linear(in_dim, hidden_dim) self.attn_fc = nn.Linear(hidden_dim, num_heads * out_dim) def forward(self, x, adj): x = self.fc(x) N = x.size()[1] x = x.view(-1, N, self.num_heads, int(x.size()[2] / self.num_heads)) x = x.permute(0, 2, 1, 3) a = self.attn_fc(x) a = a.view(-1, self.num_heads, N, N) attn = F.softmax(a, dim=-1) h = torch.matmul(attn, x) h = h.permute(0, 2, 1, 3).contiguous() h = h.view(-1, N, int(x.size()[2])) return h # 定义VAE模型 class VAE(nn.Module): def __init__(self, mlp_input_dim, mlp_hidden_dim, mlp_output_dim, mlp_history_length, gat_num_heads, gat_in_dim, gat_hidden_dim, gat_out_dim): super(VAE, self).__init__() self.mlp = MLP(mlp_input_dim, mlp_hidden_dim, mlp_output_dim, mlp_history_length) self.gat = GAT(gat_num_heads, gat_in_dim, gat_hidden_dim, gat_out_dim) self.fc1 = nn.Linear(mlp_output_dim + gat_out_dim, 256) self.fc2 = nn.Linear(256, 307 * 12 * 3) def decode(self, z): h = F.relu(self.fc1(z)) return torch.sigmoid(self.fc2(h)) def forward(self, x, adj): z, mu, logvar = self.mlp(x) gat_out = self.gat(x, adj) z = torch.cat([z, gat_out], dim=-1) return self.decode(z), mu, logvar # 定义数据集 class RandomDataset(Dataset): def __init__(self, shape): self.shape = shape def __getitem__(self, index): return torch.randn(self.shape), torch.randn(self.shape) def __len__(self): return 1000 # 随机生成数据集 dataset = RandomDataset((16, 307, 12, 3)) dataloader = DataLoader(dataset, batch_size=16, shuffle=True) # 初始化模型 mlp_input_dim = 36 mlp_hidden_dim = 64 mlp_output_dim = 12 mlp_history_length = 12 gat_num_heads = 8 gat_in_dim = 3 gat_hidden_dim = 64 gat_out_dim = 36 vae = VAE(mlp_input_dim, mlp_hidden_dim, mlp_output_dim, mlp_history_length, gat_num_heads, gat_in_dim, gat_hidden_dim, gat_out_dim) # 训练模型 optimizer = torch.optim.Adam(vae.parameters(), lr=1e-4) def loss_function(recon_x, x, mu, logvar): BCE = F.binary_cross_entropy(recon_x, x.view(-1, 307 * 12 * 3), reduction='sum') KLD = -0.5 * torch.sum(1 + logvar - mu.pow(2) - logvar.exp()) return BCE + KLD num_epochs = 10 for epoch in range(num_epochs): for i, data in enumerate(dataloader): x, adj = data optimizer.zero_grad() recon_x, mu, logvar = vae(x, adj) loss = loss_function(recon_x, x, mu, logvar) loss.backward() optimizer.step() if i % 10 == 0: print('Epoch [%d/%d], Step [%d/%d], Loss: %.4f' % (epoch+1, num_epochs, i+1, len(dataset)//16, loss.item())) # 测试模型 test_data = torch.randn(16992, 307, 12, 3) test_adj = torch.randn(16992, 307, 307) test_result = [] batch_size = 16 num_batches = test_data.shape[0] // batch_size for i in range(num_batches): x = test_data[i*batch_size:(i+1)*batch_size] adj = test_adj[i*batch_size:(i+1)*batch_size] recon_x, _, _ = vae(x, adj) test_result.append(recon_x.detach().numpy()) test_result = np.concatenate(test_result, axis=0) print(test_result.shape) ``` 在上面的代码中,MLP是一个包含三个全连接层的神经网络,GAT是一个基于图注意力机制的神经网络。VAE模型将这两个神经网络作为两个编码器,将它们的输出拼接后计算隐变量,然后解码生成新的交通数据集。输入数据集的形状为(16992,307,12,3),其中,16992是时间段数,307是传感器节点个数,12是历史步长,3是特征维度。第一个特征维度是速度,第二个特征维度是根据邻接矩阵产生的度特征,第三个特征维度是星期。按批次送入模型时,每个batch的大小为16。 在训练过程中,我们使用了随机生成的数据集进行训练,并且使用Adam优化器进行优化。在测试过程中,我们随机生成了一组符合原始数据集形状的数据集,并按批次送入模型生成新的交通数据集。
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