用C语言写一份判断一段DNA序列是否为CpG岛的程序,并且可以输入一段DNA序列,然后输出结果
时间: 2024-10-01 19:10:19 浏览: 64
在C语言中,我们可以编写一个简单的程序来判断一段DNA序列是否符合CpG岛的特性。CpG岛通常是指富含胞嘧啶(C)和鸟嘌呤(G),并且C/G比值较高的区域。这里我们假设CpG岛的C/G比率大于某个阈值,例如0.6。
```c
#include <stdio.h>
#include <string.h>
// 定义CpG岛的C/G比率阈值
#define CpG_THRESHOLD 0.6
// 检查CpG岛函数
int isCpGIsland(char *dna_sequence) {
int c_count = 0;
int g_count = 0;
double c_g_ratio;
// 遍历DNA序列
for (int i = 0; i < strlen(dna_sequence); i += 2) { // DNA的碱基对步长通常是两个
if (dna_sequence[i] == 'C' && dna_sequence[i + 1] == 'G') {
c_count++;
g_count++;
}
}
// 计算C/G比率并检查是否超过阈值
if (g_count != 0) {
c_g_ratio = (double)c_count / g_count;
} else {
c_g_ratio = 0.0; // 如果没有G,视作C/G比为0
}
return (c_g_ratio > CpG_THRESHOLD) ? 1 : 0; // 1表示是CpG岛,0表示不是
}
int main() {
char dna_input[100];
printf("请输入DNA序列(只接受CG组合,用空格分隔):");
fgets(dna_input, sizeof(dna_input), stdin);
// 移除末尾的换行符
dna_input[strlen(dna_input) - 1] = '\0';
// 调用函数并输出结果
int result = isCpGIsland(dna_input);
if (result) {
printf("%s 是CpG岛\n", dna_input);
} else {
printf("%s 不是CpG岛\n", dna_input);
}
return 0;
}
```
阅读全文