getwd() ABC <- read.csv("D:/大一/科研/AB/ABC.csv",row.names=2) head(ABC) dim(ABC) ABC_subset <- ABC[, sapply(ABC, is.numeric)] ABC_1 <- ABC[rowSums(ABC_subset) != 0, ] dim(ABC_1) group <- read_csv("D:/大一/科研/AB/group.csv") group colnames(ABC_1) == group$id library(DESeq2) ABC_1 <- as.data.frame(sapply(ABC_1, as.integer)) group$id<- as.factor(group$id) group$dex<- as.factor(group$dex) dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData=ABC_1,colData=group,design=~dex) dds<-DESeq(dds) res<-results(dds) head(res) class(res) res_1<-data.frame(res) class(res_1) head(res_1) write.csv(res_1,file="D:/大一/科研/AB/final result.csv") Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : 'row.names'里不能有重复的名字
时间: 2024-04-10 18:35:07 浏览: 139
根据错误信息,显示在写入CSV文件时发生了错误。错误信息是"'row.names'里不能有重复的名字"。
这意味着在创建`res_1`数据框时,其中的行名字(row.names)有重复的值。在写入CSV文件时,行名字必须是唯一的。
为了解决这个问题,你可以尝试重新设置行名字,以确保它们是唯一的。
```R
# 重新设置行名字
rownames(res_1) <- NULL
# 写入CSV文件
write.csv(res_1, file = "D:/大一/科研/AB/final result.csv")
```
通过将行名字设置为NULL,然后再写入CSV文件,这样就可以避免行名字重复的错误。
希望这个解决方案对你有帮助!如果还有其他问题,请随时提问。
相关问题
ABC <- read.csv("D:/大一/科研/AB/ABC.csv",row.names=2)
你已经读取了名为"ABC.csv"的文件,并将其保存到了名为`ABC`的数据框中。该文件位于"D:/大一/科研/AB/"目录下,并且使用第二列作为行名字。
如果没有出现错误,`ABC`数据框应该已经成功创建。你可以通过打印数据框的前几行来确认数据是否正确读取:
```R
head(ABC)
```
这将显示`ABC`数据框的前几行内容。
如果你还有其他问题,请随时提问。
getwd() ABC <- read.csv("D:/大一/科研/AB/ABC.csv")怎么把ABC转换为数值型
要将读取的数据框 `ABC` 转换为数值型,你可以使用 `as.numeric()` 函数。但在转换之前,需要先确定数据框中的哪些列应该是数值型的。
以下是一个示例代码,展示如何读取 CSV 文件并将其中的列转换为数值型:
```R
# 设置工作目录
setwd("D:/大一/科研/AB")
# 读取 CSV 文件
ABC <- read.csv("ABC.csv")
# 将需要转换的列索引存储到一个向量中
numeric_cols <- c(2, 3, 4) # 假设第2、3、4列是数值型的
# 循环遍历需要转换的列,并将其转换为数值型
for (col in numeric_cols) {
ABC[, col] <- as.numeric(ABC[, col])
}
# 输出结果
print(ABC)
```
在上面的示例代码中,首先使用 `setwd()` 函数设置工作目录为文件所在的路径。然后使用 `read.csv()` 函数读取 CSV 文件,并将其存储在 `ABC` 数据框中。
接下来,我们将需要转换为数值型的列索引存储在向量 `numeric_cols` 中。根据你的具体数据,将索引调整为相应的列号。
然后,我们使用一个循环遍历 `numeric_cols` 中的每个索引,将对应列的数据转换为数值型,使用 `as.numeric()` 函数。
最后,我们输出转换后的数据框 `ABC`。
请确保在运行代码之前,确认文件路径和列索引的正确性。如果还有其他问题,请随时提问。
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