变量里有bl_tg,但是R语言错误于Predict(fit, bl_tg = sort(dataz2$bl_tg), fun = exp, ref.zero = T): predictors(s) not in model: bl_tg

时间: 2024-09-16 20:04:03 浏览: 36
在R语言中,当你尝试使用`predict()`函数对模型进行预测时,如果报错"predictors(s) not in model: bl_tg",这意味着你试图使用的变量`bl_tg`并没有包含在你当前的模型`fit`中。模型`fit`可能只考虑了其他的一些特征或者已经被处理过,而`bl_tg`这个变量在构建模型的时候并未作为预测因子。 解决这个问题,你需要确认以下几个步骤: 1. 确认`bl_tg`是否是你想要用于预测的变量,它是否应该存在于你的训练数据集`dataz2`中。 2. 检查一下`fit`模型的公式或`formula()`,确认`bl_tg`是不是被排除在外或者没有作为自变量(left-hand side)指定。 3. 如果`bl_tg`是一个需要预处理或转换的变量,确保在建模前已经将其添加到适当的位置并进行了正确的编码。 如果你的`bl_tg`确实应该用于预测,那么可能需要重建模型,将`bl_tg`加入到预测公式中,例如: ```r fit_new <- lm(y ~ ., data = cbind(dataz2[, -which(names(dataz2) == "bl_tg")], bl_tg)) ``` 这会创建一个新的模型,其中包含了`bl_tg`作为潜在的预测因素。
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错误于rms::Predict(fit, bl_tg = sort(dataz2$bl_tg), fun = exp, ref.zero = T): predictors(s) not in model: bl_tg

这个错误信息是在使用R语言的`rms`包中的`Predict()`函数时发生的,函数尝试预测一个`fit`模型的结果,其中包含了`bl_tg`这个变量。然而,当你运行`Predict()`时,这个变量并没有包含在你之前构建的`fit`模型中。 `ref.zero = T`表示你希望参考水平(reference level)被设置为0,这通常是针对连续变量的。`fun = exp`表明你想要对预测结果取自然指数(exp)以便得到危险比,这是Cox模型常见的操作。 所以,解决这个问题的步骤应该是先确认`bl_tg`是否应该作为预测的一部分,并将其加入到`coxph()`模型中。如果你确信它应该在模型中,那么你需要检查一下模型建立的时候是否遗漏了这个变量: ```r # 确保bl_tg已经包含在fit模型中 fit <- coxph(Surv(time, status) ~ variable1 + variable2 + bl_tg, data = dataz2) # 现在你可以安全地使用Predict()函数 predictors <- predict(fit, newdata = dataz2, bl_tg = sort(dataz2$bl_tg), fun = exp, ref.zero = T) ```

在运行以下R代码时:# 分别绘制三组岭回归的图 # 绘制第一组交叉验证误差图 ggplot(data = data.frame(lambda = cv1$glmnet.fit$lambda, cvm = cv1$glmnet.fit$cvm), aes(x = log(lambda), y = cvm)) + geom_line() + scale_x_reverse() + labs(title = "Cross-validation Error Plot for First Model") # 绘制第一组预测误差图 yhat1 <- predict(ridge1, s = cv1$glmnet.fit$lambda.1se, newx = X) ggplot(data.frame(y = y, yhat = yhat1), aes(x = y, y = yhat)) + geom_abline() + geom_point() + labs(title = "Predicted vs. Actual Plot for First Model") # 绘制第二组交叉验证误差图 ggplot(data = data.frame(lambda = cv2$glmnet.fit$lambda, cvm = cv2$glmnet.fit$cvm), aes(x = log(lambda), y = cvm)) + geom_line() + scale_x_reverse() + labs(title = "Cross-validation Error Plot for Second Model") # 绘制第二组预测误差图 yhat2 <- predict(ridge2, s = cv2$glmnet.fit$lambda.1se, newx = X) ggplot(data.frame(y = y, yhat = yhat2), aes(x = y, y = yhat)) + geom_abline() + geom_point() + labs(title = "Predicted vs. Actual Plot for Second Model") # 绘制第三组交叉验证误差图 ggplot(data = data.frame(lambda = cv3$glmnet.fit$lambda, cvm = cv3$glmnet.fit$cvm), aes(x = log(lambda), y = cvm)) + geom_line() + scale_x_reverse() + labs(title = "Cross-validation Error Plot for Third Model") # 绘制第三组预测误差图 yhat3 <- predict(ridge3, s = cv3$glmnet.fit$lambda.1se, newx = X) ggplot(data.frame(y = y, yhat = yhat3), aes(x = y, y = yhat)) + geom_abline() + geom_point() + labs(title = "Predicted vs. Actual Plot for Third Model")。发生以下错误:Error in data.frame(lambda = cv1$glmnet.fit$lambda, cvm = cv1$glmnet.fit$cvm) : 参数值意味着不同的行数: 100, 0。请对原代码进行修正

这个错误发生在第一组交叉验证误差图的代码中,可能是由于cv1$glmnet.fit$cvm为空而导致的。为了修正这个错误,你可以添加一个条件语句来检查cvm是否为空,如果不为空再绘制图形,代码如下: ```R if (!is.null(cv1$glmnet.fit$cvm)) { ggplot(data = data.frame(lambda = cv1$glmnet.fit$lambda, cvm = cv1$glmnet.fit$cvm), aes(x = log(lambda), y = cvm)) + geom_line() + scale_x_reverse() + labs(title = "Cross-validation Error Plot for First Model") } ``` 你也可以为每组图形添加这样的条件语句,以确保安全地绘制图形。

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