nx.from_pandas_edgelist这个函数讲一下

时间: 2024-03-19 14:43:58 浏览: 19
nx.from_pandas_edgelist 函数是 NetworkX 库提供的一个函数,用于从 Pandas 数据框中创建一个图。 该函数将 Pandas 数据框中的每一行当作一条边,从源节点指向目标节点。具体来说,它需要以下参数: - df:Pandas 数据框,它包含了图的边信息。 - source:源节点列名。 - target:目标节点列名。 - edge_attr:边属性列名,可以是一个字符串或者是一个元组列表。如果为 None,则只创建一个无权图。 该函数的返回值是一个 NetworkX 图对象。 例如,对于下面这个 Pandas 数据框 df: ``` source target weight 0 A B 1 1 B C 2 2 C A 3 ``` 我们可以使用以下代码创建一个有权图: ```python import pandas as pd import networkx as nx df = pd.read_csv('edge_list.csv') G = nx.from_pandas_edgelist(df, source='source', target='target', edge_attr='weight') ``` 这将创建一个有权图 G,其中包含三个节点 A、B 和 C,以及三条边 (A, B, 1)、(B, C, 2) 和 (C, A, 3)。
相关问题

nx.from_pandas_edgelist

### 回答1: nx.from_pandas_edgelist是一个NetworkX函数,用于将Pandas DataFrame转换为NetworkX图形。它将DataFrame中的每一行解释为一条边,并使用DataFrame中的列作为边的源和目标节点。该函数返回一个NetworkX图形对象。 ### 回答2: nx.from_pandas_edgelist是NetworkX中一个非常有用的函数,主要作用是将Pandas DataFrame对象转换为NetworkX图对象。这个函数主要需要两个参数,第一个是Pandas DataFrame对象,第二个则是用于表示边的源节点和目标节点的列名。 nx.from_pandas_edgelist的使用非常简单,只需要将Pandas DataFrame对象传递给该函数即可。在传递DataFrame对象时,需要指定每个节点和边的特征属性,并将这些属性值转换到对应的NetworkX属性。此外,如果不指定必要的属性,则函数会自动将源节点和目标节点视为边的两个节点,并将任何其他列视为边的属性。 这个函数还可以接受其他参数,比如指定边是否有向,边的权重等。如果边的权重没有提供,则默认情况下会被设置为1.0。最后,由于Pandas DataFrame对象可能很大,可以通过使用chunks参数控制每个批次的大小来降低内存消耗。 总而言之,这个函数为Pandas DataFrame对象与NetworkX图对象之间的相互转换提供了一个非常有效的方法,使得数据处理操作更加高效和方便。无论是在数据科学、网络分析、社交网络、运筹学等领域,这个函数都有着广泛的应用和作用,是数据分析、数据预处理中的一个必备的函数。 ### 回答3: nx.from_pandas_edgelist是一个NetworkX库中的函数,它允许将Pandas dataframe(数据框架)转换为NetworkX图形。 这个函数需要一个Pandas dataframe作为输入,该数据框架应包含至少两个列,每个列代表一个节点。Pandas dataframe中的每一行代表一个边缘,它连接两个节点。边缘可以被有选择地加权。 nx.from_pandas_edgelist函数将创建一个无向图(如果在Pandas dataframe中没有权重列),或一个有向图(如果在Pandas dataframe中有权重列)。 需要注意的是,nx.from_pandas_edgelist函数假定输入数据框架使用默认列名称“source”和“target”来表示两个节点。如果这两个列的名称在输入数据框架中不同,则必须使用参数source和target来指定这些列的名称。 另外,需要确保输入数据框架没有重复的边缘,否则会导致创建重复的图。这可以通过使用Pandas dataframe中的drop_duplicates函数来解决。 最后,需要注意的是,nx.from_pandas_edgelist函数返回的是一个NetworkX图形对象,可以与其他NetworkX函数和库进行交互,比如计算图的中心性或生成它的可视化。

如果不用创建新图,而是根据之前通过代码G = nx.from_pandas_edgelist(df, 'source', 'target','weight', create_using = nx.DiGraph())已导入的数据计算,应该怎么修改呢

如果你已经通过`nx.from_pandas_edgelist`方法将数据导入为图,那么可以直接使用该图进行计算,而无需创建新图。你可以按照以下方式修改代码: ```python import networkx as nx def calculate_yi(graph): yi_values = {} for node in graph.nodes: yi = 0 for neighbor in graph.neighbors(node): wij = graph[node][neighbor]['weight'] si = graph.nodes[node]['strength'] yi += (wij / si) ** 2 yi_values[node] = yi return yi_values # 假设你已经通过nx.from_pandas_edgelist方法导入了图数据为G # 添加节点的强度属性 G.nodes[1]['strength'] = 1.2 G.nodes[2]['strength'] = 0.9 G.nodes[3]['strength'] = 1.5 G.nodes[4]['strength'] = 1.0 # 计算所有yi值 yi_values = calculate_yi(G) print(yi_values) ``` 在这个修改的代码中,我们假设你已经通过`nx.from_pandas_edgelist`方法将数据导入为了图`G`。然后,我们在图的节点上添加了强度属性,并调用`calculate_yi`函数计算所有的yi值。最后,我们打印输出了所有的yi值。请确保在运行代码之前,已经正确导入了图数据。

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import networkx as nx import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt import networkx as nx import random df=pd.read_csv("D:\级联失效\edges.csv") G=nx.from_pandas_edgelist(df,'from','to',create_using=nx.Graph()) nx.draw(G,node_size=300,with_labels=True) As=nx.adjacency_matrix(G) A=As.todense() def f(x): F=4*x*(1-x) return F n=len(A) r=2 ohxs=0.4 step=10 d=np.zeros([n,step]) for i in range(n): d[i,0]=np.sum(A[i]) x_intial=np.zeros([n,step]) for i in range(n): x_intial[i,0]=random.random() np.set_printoptions(precision=5) h_a=100 H=np.zeros([n,step]) D=np.zeros([n,step]) for i in range(n): Deg=0 for k in range(n): if k!=i: Deg=Deg+d[k,0] D[i,0]=Deg H[i,0]=d[i,0]/D[i,0]/h_a fail_scale=np.zeros(step) fail_scale[0]=1 node_rand_id=random.randint(0,n) r=2 x_intial[node_rand_id,0]=x_intial[node_rand_id,0]+r print(x_intial) fail_node=np.zeros(n) fail_node[node_rand_id]=1 print(fail_node) np.seterr(divide='ignore',invalid='ignore') for t in range(1,step): fail_node_id=[idx for (idx,val) in enumerate(fail_node) if val ==1] for i in range(n): sum=0 for j in range(n): sum = sum+A[i,j]*f(x_intial[j,t-1])/d[i] if i in fail_node_id: x_intial[i,t-1]=0 A[i,:]=0 A[:,i]=0 else: x_intial[i,t]=H[i,t-1]*abs((1-ohxs)*f(x_intial[i,t-1])+ohxs*sum) d[i,t]=np.sum(A[i]) Deg=0 for k in range(n): if k!=i: Deg=Deg+d[i,t] D[i,t]=Deg H[i,t]=d[i,t]/D[i,t]/h_a new_fail_id=[idx for (idx,val) in enumerate(x_intial[:,t]) if val>=1] fail_scale[t]=fail_scale[t-1]+len(new_fail_id) fail_node[new_fail_id]=1 x_intial[new_fail_id,t]=x_intial[new_fail_id,t]+r print(H[i,t]) print(fail_node) print(x_intial) plt.plot(fail_scale) plt.show()

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好的,根据上面的目标函数,我们可以推导出其对应的梯度向量函数,如下所示: def gradient(x, y, beta): """ Compute gradient of the logistic regression loss function :param beta: model parameter vector :param x: feature matrix :param y: label vector :return: gradient vector """ n = x.shape[0] pred = 1 /
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