肿瘤突变负荷 tmb R语言计算

您可以使用R语言的一些包来计算肿瘤突变负荷（Tumor Mutational Burden，TMB）。下面是一个示例代码，使用"maftools"包来计算TMB：

# 安装并加载maftools包
install.packages("maftools")
library(maftools)

# 读取MAF文件
maf <- read.maf("path/to/your/maf/file.maf")

# 计算TMB
tmb <- calc_TMB(maf, type = "WES", genome_size = 3000)

# 打印TMB结果
print(tmb)

在上面的代码中，您需要将"path/to/your/maf/file.maf"替换为您的MAF文件的实际路径。请确保您的MAF文件包含足够的样本和突变信息。

这只是一个简单的示例代码，您可以根据具体的数据和需求进行适当的调整。另外，请注意在运行代码之前，确保已经安装了"maftools"包，并且加载了所需的其他包。