写一个python脚本，调用linux下的blast和kraken2比对序列，并保存结果

以下是一个简单的Python脚本，可以调用Linux下的blast和kraken2比对序列，并将结果保存到指定的文件中。

import os

# 定义blast和kraken2的命令
blast_cmd = 'blastn -query input.fasta -db database -out blast_result.txt'
kraken2_cmd = 'kraken2 --db database --output kraken_result.txt input.fasta'

# 执行blast和kraken2命令
os.system(blast_cmd)
os.system(kraken2_cmd)

在上面的脚本中，`input.fasta`是待比对的序列文件，`database`是blast和kraken2所使用的数据库名称，可以根据实际情况进行修改。比对结果分别保存在`blast_result.txt`和`kraken_result.txt`文件中。如果需要将结果读入Python程序进行处理，可以使用相应的文件读取函数进行操作。