def TestBiLSTM(bilstm, test_dataloader, max_speed): inputs, labels = next(iter(test_dataloader)) [batch_size, step_size, fea_size] = inputs.size() # bilstm.cuda() cur_time = time.time() pre_time = time.time() use_gpu = torch.cuda.is_available() bilstm.eval() for data in test_dataloader: inputs, labels = data if inputs.shape[0] != batch_size: continue if use_gpu: inputs, labels = Variable(inputs.cuda()), Variable(labels.cuda()) else: inputs, labels = Variable(inputs), Variable(labels) Hidden_State_f,Cell_State_f,Hidden_State_b,Cell_State_b= bilstm.initHidden(batch_size=40) outputs = bilstm.forward(inputs) print(outputs) return outputs如果要将这段代码的输出进行结果可视化,还需要哪些信息才能生成散点图

时间: 2023-06-20 17:09:51 浏览: 241
要将这段代码的输出进行结果可视化,还需要以下信息: 1. labels(真实值):可以将其作为散点图的y轴坐标。 2. outputs(预测值):可以将其作为散点图的x轴坐标。 3. max_speed(最大速度):可以用于设置散点图的x轴和y轴的范围。 根据以上信息,可以使用matplotlib库绘制散点图,代码示例如下: ``` import matplotlib.pyplot as plt # 获取真实值和预测值 outputs = TestBiLSTM(bilstm, test_dataloader, max_speed) _, pred = torch.max(outputs, 1) labels = labels.cpu().numpy() pred = pred.cpu().numpy() # 绘制散点图 plt.scatter(pred, labels, s=10) plt.xlim(0, max_speed) plt.ylim(0, max_speed) plt.xlabel('Predicted Speed') plt.ylabel('True Speed') plt.show() ```
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#定义一个get_fea类函数,返回类变量x0 def get_fea_x0(self): return self.fea_x0 def get_fea_x1(self): return self.fea_x1 def get_fea_x2(self): return self.fea_x2 def get_fea_x3(self): return self.fea_x3 卷积神经网络已建立,利用上述代码,在此基础上修改出pytorch框架下调用指定层的tsne 中文回答 2023/5/26 11:07:08

感谢您提供的更多上下文信息。要在PyTorch框架下调用指定层的TSNE,需要进行以下步骤: 1. 首先,您需要使用PyTorch构建卷积神经网络,并将其训练。在训练过程中,您需要将不同层的特征提取出来,并保存到一个列表中。 2. 接下来,您可以使用scikit-learn中的TSNE类来实现降维。您需要将保存的特征列表作为输入,调用fit_transform函数来获得降维后的特征表示。 3. 最后,您可以使用Matplotlib等库可视化降维后的特征表示。 下面是一个示例代码,您可以根据您的具体需求进行修改和调整: ```python import torch import numpy as np from sklearn.manifold import TSNE import matplotlib.pyplot as plt # 定义卷积神经网络 class CNN(torch.nn.Module): def __init__(self): super(CNN, self).__init__() self.conv1 = torch.nn.Conv2d(3, 32, 3, padding=1) self.conv2 = torch.nn.Conv2d(32, 64, 3, padding=1) self.conv3 = torch.nn.Conv2d(64, 128, 3, padding=1) self.fc1 = torch.nn.Linear(128 * 8 * 8, 512) self.fc2 = torch.nn.Linear(512, 10) def forward(self, x): x = torch.nn.functional.relu(self.conv1(x)) x = torch.nn.functional.max_pool2d(x, 2) x = torch.nn.functional.relu(self.conv2(x)) x = torch.nn.functional.max_pool2d(x, 2) x = torch.nn.functional.relu(self.conv3(x)) x = torch.nn.functional.max_pool2d(x, 2) x = x.view(-1, 128 * 8 * 8) x = torch.nn.functional.relu(self.fc1(x)) x = self.fc2(x) return x # 定义一个函数,用于获取指定层的特征 def get_feature_maps(model, x, layer_num): feature_maps = [] for i in range(layer_num): x = model[i](x) feature_maps.append(x) return feature_maps # 加载数据集 train_loader = torch.utils.data.DataLoader( torchvision.datasets.CIFAR10( root='./data', train=True, download=True, transform=torchvision.transforms.Compose([ torchvision.transforms.ToTensor(), torchvision.transforms.Normalize( (0.5, 0.5, 0.5), (0.5, 0.5, 0.5)) ])), batch_size=32, shuffle=True) # 实例化卷积神经网络 model = CNN() # 训练卷积神经网络 criterion = torch.nn.CrossEntropyLoss() optimizer = torch.optim.SGD(model.parameters(), lr=0.001, momentum=0.9) for epoch in range(10): for i, (inputs, labels) in enumerate(train_loader): optimizer.zero_grad() outputs = model(inputs) loss = criterion(outputs, labels) loss.backward() optimizer.step() # 获取指定层的特征 layer_num = 3 inputs, labels = next(iter(train_loader)) feature_maps = get_feature_maps(model, inputs, layer_num) # 转换特征为numpy数组 feature_maps_np = [fm.detach().numpy() for fm in feature_maps] # 将特征转换为二维数组 feature_maps_np_2d = [fm.reshape(fm.shape[0], -1) for fm in feature_maps_np] # 使用TSNE降维 tsne = TSNE(n_components=2, random_state=0) feature_maps_tsne = [tsne.fit_transform(fm) for fm in feature_maps_np_2d] # 可视化降维后的特征 for i in range(layer_num): plt.figure() plt.scatter(feature_maps_tsne[i][:, 0], feature_maps_tsne[i][:, 1], c=labels) plt.title('Layer {}'.format(i+1)) plt.show() ``` 这个示例代码演示了如何在PyTorch框架下调用指定层的TSNE,您可以根据您的具体需求进行修改和调整。

编写pytorch代码,定义LSTMAttention模型,定义一个FA_CPSO优化算法,用FA_CPSO算法有优化模型中神经元个数、dropout比率、batch_size、学习率等超参数,将优化好的超参数传递给模型,在特征训练集X_train.csv和标签训练集y_train.csv上训练模型,将最优的参数设置给模型,在特征测试集X_test.csv和标签测试集y_test.csv上测试模型,进一步优化模型,将优化后的参数设置给模型,并输出测试损失,绘制测试集的预测值和实际值,计算测试集的均方根误差,在预测集上进行预测,设定标签数据最大值的85%为警戒线,绘制预测集的实际值到达的时间和预测值到达的时间

好的,我了解了你的要求。首先,需要安装pytorch和pandas库。 以下是代码实现: ```python import torch import torch.nn as nn import pandas as pd import numpy as np from scipy.stats import uniform from sko.PSO import PSO # 定义LSTMAttention模型 class LSTMAttention(nn.Module): def __init__(self, input_size, hidden_size, output_size, num_layers, dropout): super(LSTMAttention, self).__init__() self.hidden_size = hidden_size self.num_layers = num_layers self.lstm = nn.LSTM(input_size, hidden_size, num_layers, batch_first=True, bidirectional=True) self.dropout = nn.Dropout(dropout) self.fc1 = nn.Linear(hidden_size * 2, output_size) self.softmax = nn.Softmax(dim=1) def forward(self, x): h0 = torch.zeros(self.num_layers * 2, x.size(0), self.hidden_size).to(device) c0 = torch.zeros(self.num_layers * 2, x.size(0), self.hidden_size).to(device) out, _ = self.lstm(x, (h0, c0)) out = self.dropout(out) out = self.fc1(out[:, -1, :]) out = self.softmax(out) return out # 加载数据 X_train = pd.read_csv('X_train.csv') y_train = pd.read_csv('y_train.csv') X_test = pd.read_csv('X_test.csv') y_test = pd.read_csv('y_test.csv') # 转换数据格式 X_train = torch.from_numpy(X_train.values).float() y_train = torch.from_numpy(y_train.values).long().squeeze() X_test = torch.from_numpy(X_test.values).float() y_test = torch.from_numpy(y_test.values).long().squeeze() # 定义超参数空间 dim = 4 lb = [16, 0.1, 64, 0.0001] ub = [256, 0.5, 256, 0.1] pso_bound = np.array([lb, ub]) # 定义FA_CPSO优化算法 class FA_CPSO(PSO): def __init__(self, func, lb, ub, dimension, size_pop=50, max_iter=300, w=0.8, c1=2, c2=2, c3=2, p=0.5): super().__init__(func, lb, ub, dimension, size_pop, max_iter, w, c1, c2, p) self.c3 = c3 # FA_CPSO新增参数 self.S = np.zeros((self.size_pop, self.dimension)) # 储存每个个体的历代最优位置 self.F = np.zeros(self.size_pop) # 储存每个个体的当前适应度值 self.Fbest = np.zeros(self.max_iter + 1) # 储存每次迭代的最优适应度值 self.Fbest[0] = self.gbest_y self.S = self.X.copy() def evolve(self): self.F = self.cal_fitness(self.X) self.Fbest[self.gbest_iter] = self.gbest_y for i in range(self.size_pop): if uniform.rvs() < self.p: # 个体位置更新 self.X[i] = self.S[i] + self.c3 * (self.gbest - self.X[i]) + self.c1 * \ (self.pbest[i] - self.X[i]) + self.c2 * (self.pbest[np.random.choice(self.neighbor[i])] - self.X[i]) else: # 个体位置更新 self.X[i] = self.S[i] + self.c1 * (self.pbest[i] - self.X[i]) + self.c2 * (self.pbest[np.random.choice(self.neighbor[i])] - self.X[i]) # 边界处理 self.X[i] = np.clip(self.X[i], self.lb, self.ub) # 适应度值更新 self.F[i] = self.func(self.X[i]) # 个体历代最优位置更新 if self.F[i] < self.func(self.S[i]): self.S[i] = self.X[i] # 全局最优位置更新 self.gbest = self.S[self.F.argmin()] self.gbest_y = self.F.min() # 定义优化目标函数 def objective_function(para): hidden_size, dropout, batch_size, learning_rate = para model = LSTMAttention(10, hidden_size, 2, 2, dropout).to(device) criterion = nn.CrossEntropyLoss() optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=learning_rate) train_dataset = torch.utils.data.TensorDataset(X_train, y_train) train_loader = torch.utils.data.DataLoader(train_dataset, batch_size=batch_size, shuffle=True) for epoch in range(100): for i, (inputs, labels) in enumerate(train_loader): inputs = inputs.to(device) labels = labels.to(device) optimizer.zero_grad() outputs = model(inputs) loss = criterion(outputs, labels) loss.backward() optimizer.step() test_dataset = torch.utils.data.TensorDataset(X_test, y_test) test_loader = torch.utils.data.DataLoader(test_dataset, batch_size=len(test_dataset)) for inputs, labels in test_loader: inputs = inputs.to(device) labels = labels.to(device) outputs = model(inputs) pred = torch.argmax(outputs, dim=1) test_loss = criterion(outputs, labels) rmse = torch.sqrt(torch.mean((pred - labels) ** 2)) return test_loss.item() + rmse.item() # 运行FA_CPSO算法进行超参数优化 device = torch.device('cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu') fa_cpso = FA_CPSO(objective_function, lb, ub, dim, size_pop=50, max_iter=100) fa_cpso.run() # 输出最优超参数 best_hidden_size, best_dropout, best_batch_size, best_learning_rate = fa_cpso.gbest # 使用最优超参数训练模型 model = LSTMAttention(10, best_hidden_size, 2, 2, best_dropout).to(device) criterion = nn.CrossEntropyLoss() optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=best_learning_rate) train_dataset = torch.utils.data.TensorDataset(X_train, y_train) train_loader = torch.utils.data.DataLoader(train_dataset, batch_size=best_batch_size, shuffle=True) for epoch in range(100): for i, (inputs, labels) in enumerate(train_loader): inputs = inputs.to(device) labels = labels.to(device) optimizer.zero_grad() outputs = model(inputs) loss = criterion(outputs, labels) loss.backward() optimizer.step() # 在测试集上进行预测 test_dataset = torch.utils.data.TensorDataset(X_test, y_test) test_loader = torch.utils.data.DataLoader(test_dataset, batch_size=len(test_dataset)) for inputs, labels in test_loader: inputs = inputs.to(device) labels = labels.to(device) outputs = model(inputs) pred = torch.argmax(outputs, dim=1) test_loss = criterion(outputs, labels) test_rmse = torch.sqrt(torch.mean((pred - labels) ** 2)) # 输出测试损失和测试集的均方根误差 print('Test loss: {:.4f}, Test RMSE: {:.4f}'.format(test_loss.item(), test_rmse.item())) # 绘制测试集的预测值和实际值 import matplotlib.pyplot as plt plt.plot(pred.cpu().numpy(), label='Predict') plt.plot(labels.cpu().numpy(), label='Actual') plt.legend() plt.show() # 在预测集上进行预测 X_pred = torch.from_numpy(pd.read_csv('X_pred.csv').values).float().to(device) outputs = model(X_pred) pred = torch.argmax(outputs, dim=1) # 计算预测值到达警戒线的时间和实际值到达警戒线的时间 threshold = y_train.max() * 0.85 pred_time = np.argmax(pred.cpu().numpy() >= threshold) actual_time = np.argmax(y_test.cpu().numpy() >= threshold) # 绘制预测集的实际值到达的时间和预测值到达的时间 plt.axvline(x=pred_time, color='r', linestyle='--') plt.axvline(x=actual_time, color='g', linestyle='--') plt.plot(pred.cpu().numpy(), label='Predict') plt.plot(y_test.cpu().numpy(), label='Actual') plt.legend() plt.show() ``` 请注意,这只是一个代码示例,可能需要根据数据集的特点进行调整和修改。
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