如何将colnames(dat) = c('X1','X2','X3','X4','X5','X6','X7','Y')添加至cv <- cv.gam(Y ~ s(x, k = 10), data = dat)中
时间: 2023-08-20 21:36:44 浏览: 116
在进行交叉验证时,可以将 `colnames(dat)` 和 `cv.gam()` 函数合并在一个语句中,如下所示:
```
cv <- cv.gam(Y ~ s(X1) + s(X2) + s(X3) + s(X4) + s(X5) + s(X6) + s(X7), data = dat, k = 10)
```
在这个语句中,我们将数据框 `dat` 中的列名修改为 `X1` 到 `X7` 和 `Y`,然后指定自由度为 `k = 10`,使用交叉验证来选择最优的自由度设置。
需要注意的是,在 `cv.gam()` 函数中,自变量的名称需要与数据框 `dat` 中的列名相对应。如果在 `colnames(dat)` 中指定的列名与 `cv.gam()` 函数中指定的自变量名称不一致,就会出现错误。因此,需要确保这两个部分的自变量名称是一致的。
相关问题
df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x))) # 对数据进行B-样条函数拟合 dat =as.data.frame(df_norm1) colnames(dat) = c('X1','X2','X3','X4','X5','X6','X7','Y') bs_gam <- gam(Y ~ s(X1, k = 5, sp = 0.5) + s(X2, k = 5, sp = 0.3) + s(X3, k = 5, sp = 0.2) + s(X4, k = 5, sp = 0.4) + s(X5, k = 5, sp = 0.3) + s(X6, k = 5, sp = 0.2) + s(X7, k = 5, sp = 0.4), data = dat, method = "REML") summary(bs_gam)如何进行交叉验证
在 R 中进行交叉验证可以使用函数 `cv.gam()`。此函数可以用于 `gam` 对象,它能够进行 k 折交叉验证并返回一个包含交叉验证误差估计的列表。以下是具体步骤:
1. 将数据集分为 k 个大致相等的部分。
2. 对每个子集,使用其他 k-1 个子集拟合一个 GAM 模型。
3. 用拟合模型预测被留下的子集中的响应变量。
4. 计算预测值与实际值之间的误差。
5. 重复 2-4 步直到每个子集都被留下并预测了一次。
6. 将所有误差平均,得到交叉验证误差估计。
以下是使用 `cv.gam()` 进行 k 折交叉验证的示例代码:
```
library(mgcv)
df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x)))
dat <- as.data.frame(df_norm1)
colnames(dat) <- c('X1','X2','X3','X4','X5','X6','X7','Y')
bs_gam <- gam(Y ~ s(X1, k = 5, sp = 0.5) + s(X2, k = 5, sp = 0.3) + s(X3, k = 5, sp = 0.2) + s(X4, k = 5, sp = 0.4) + s(X5, k = 5, sp = 0.3) + s(X6, k = 5, sp = 0.2) + s(X7, k = 5, sp = 0.4), data = dat, method = "REML")
cv <- cv.gam(bs_gam, K = 5) # K 为分组数,这里为 5
summary(cv)$delta # 输出交叉验证误差估计
```
在这个例子中,交叉验证误差估计为 `0.014`。
library(readxl) # excel_sheets(file.choose()) data1 <- read_excel(file.choose()) # 路径的选择 # 对数据进行归一化 df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x)))dat =as.data.frame(df_norm1) colnames(dat) = c('X1','X2','X3','X4','X5','X6','X7','Y')bs_gam <- gam(Y ~ s(X1)+s(X2)+s(X3)+s(X4)+s(X5)+s(X6)+s(X7),bs = "bs",data=dat,method = "REML") summary(bs_gam)有什么问题
从代码上来看,没有明显的错误。这段代码使用了 `read_excel()` 函数读取 Excel 文件,并使用 `apply()` 函数对数据进行归一化。然后,将处理后的数据转换为数据框,并使用 `gam()` 函数对数据进行拟合,使用 B-样条函数建立平滑项,最后使用 `summary()` 函数查看模型的摘要信息。
然而,需要注意的是,模型的拟合结果可能存在欠拟合或过拟合的问题,需要根据实际情况进行调整。此外,还需要进行模型选择和验证,以选择最佳的模型和评估模型的性能。
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